Аналізи ДНК в Україні
Всі аналізи/Панелі (секвенування NGS)
Є панель з 24 генів, яка включає оцінку некодуючих варіантів. Ідеально підходить для пацієнтів з клінічним діагнозом або підозрою на лісенцефалію.
Ліссенцефалія є групою рідкісних вад розвитку, об'єднаних загальною ознакою аномалій у вигляді звивин головного мозку, що характеризуються спрощенням або відсутністю складчастості, пов'язаних з аномальною організацією шарів кори. Лісенцефалія відноситься до «гладкого мозку» з відсутністю звивин (агірія) або аномально широкими звивинами (пахігірія).
Класична ліссенцефалія (раніше тип I) являє собою ваду розвитку головного мозку, спричинену аномальною міграцією нейронів на терміні від 9 до 13 тижнів вагітності, що призводить до спектру агірії, змішаної агірії/пахігірії та пахігірії. Він характеризується аномально товстою, погано організованою корою з чотирма примітивними шарами (замість шести в нормі), дифузною гетеротопією нейронів, збільшеними та дисморфними шлуночками та часто гіпоплазією мозолистого тіла.
У дітей з ліссенцефалією відзначаються проблеми з годуванням та ковтанням, аномалії м'язового тонусу (рання гіпотонія, а потім гіпертонус кінцівок), судоми (зокрема, інфантильні спазми) та виражена психомоторна загальмованість.
Описано кілька типів лісенцефалії, хоча вони мають риси, що перекриваються: класична лісенцефалія (гени LIS1 (PAFAH1B1), гени DCX і TUBA1A з аутосомно-домінантним і Х-зчепленим успадкуванням), лісенцефалія1A та гіпозі TUBB2B , аутосомно-домінантний), лісенцефалія з гіпоплазією мозочка, рилінопатичний тип ( RELN і VLDLR , аутосомно-рецесивний) , кіркова мальформація бруківкового типу ( FKTN, LARGE і POMT1 , AR ARX, Х-зчеплений). Найбільш поширені класична ліссенцефалія та бруківка. Частота всіх форм ліссенцефалії І типу становить близько 1/100 000 новонароджених.
Ген | Асоційований фенотип | Спадкоємність.* | ClinVar** | HGMD** |
---|---|---|---|---|
ACTB | Синдром Барайтсера-Вінтера | AD | 55 | 60 |
ACTG1 | Глухота, синдром Барайтсера-Вінтера | AD | 27 | 47 |
ARX | Ліссенцефалія, епілептична енцефалопатія, мозолисте тіло, агенезія, з аномаліями геніталій, синдром Партингтона, синдром Прауда, гідрененцефалія з аномаліями геніталій, розумова відсталість | XL | 66 | 93 |
ATP6V0A2 | Cutis laxa, синдром зморшкуватої шкіри | AR | 16 | 56 |
CIT | Мікроцефалія 17, первинна, аутосомно-рецесивна | AR | 9 | 14 |
CRADD | Розумова відсталість, аутосомно-рецесивна 34, з варіантною ліссенцефалією | AR | 4 | 6 |
DCX | Лісенцефалія, субкортикальна ламінальна гетеротопія | XL | 131 | 142 |
FKTN | М'язова дистрофія-дистрогліканопатія, дилатаційна кардіоміопатія (ДКМП), м'язова дистрофія-дистрогліканопатія (кінцево-поясна) | AD/AR | 45 | 58 |
ISPD | М'язова дистрофія-дистрогліканопатія | AR | 38 | 53 |
KATNB1 | Лісенцефалія 6, з мікроцефалією | AR | 6 | 10 |
KIAA1109 | Черепно-лицевий дисморфізм, скелетні аномалії та синдром розумової відсталості | AR | 7 | 16 |
LAMB1 | Лісенцефалія 5 | AR | 8 | 7 |
LARGE | М'язова дистрофія-дистрогліканопатія | AR | 19 | 27 |
MACF1 | лісенцефалія | AD | 1 | 9 |
PAFAH1B1 | Лісенцефалія, підкіркова ламінарна гетеротопія | AD | 121 | 169 |
POMGNT2 | М'язова дистрофія-дистрогліканопатія (вроджена з аномаліями головного мозку та очей), тип А, 8 | AR | 6 | 9 |
POMT1 | М'язова дистрофія-дистрогліканопатія | AR | 47 | 96 |
RELN | Лісенцефалія, епілепсія, сімейна скронева частка | AD/AR | 25 | 44 |
TMTC3 | Лісенцефалія 8 | 6 | 10 | |
TUBA1A | лісенцефалія | AD | 69 | 65 |
TUBB2B | Полімікрогірія, асиметрична | AD | 21 | 30 |
TUBG1 | Коркова дисплазія комплексна з іншими вадами розвитку головного мозку 4 | AD | 5 | 3 |
VLDLR | Мозочкова атаксія, розумова відсталість та синдром нерівноваги | AR | 11 | 24 |
YWHAE | Синдром дистальних мікроделецій 17p13.3, ендометріальна стромальна саркома, синдром мікродуплікації 17p13.3, синдром Міллера-Дікера | AD/AR | 12 | 44 |
* Тип успадкування: аутосомно-домінантний (AD), аутосомно-рецесивний (AR), мітохондріальний (mi), Х-зчеплений (XL), Х-зчеплений домінантний (XLD) та Х-зчеплений рецесивний (XLR); ** ClinVar, HGMD - кількість варіантів гена, класифікованих як патогенні або ймовірно патогенні в базі даних ClinVar, HGMD.
В панель дозволяється додати додаткові гени (до 200), пов'язані з симптомами, та видалити будь-які гени (щоб залишилося не менше 2). Вартість панелі може змінюватися, а саме:
- мала панель 2-25 генів ,
- середня панель 26-125 генів ,
- велика панель понад 126 генів .
Якщо аналіз виявив варіанти, що є можливою причиною хвороби, можна перевірити наявність цих варіантів у батьків. Аналіз окремих мутацій по Сенгеру.
Якщо аналіз не виявив варіантів, які є можливою причиною хвороби, можна розширити тестування до повного екзома Розширення панелі до повного екзома. Крім того, можна отримати сирі дані і робити повторну оцінку кожні кілька років. Можливо, згодом науці стануть відомі нові генетичні чинники захворювання.
Натще не потрібно, рясно пити воду.
Проводиться забір венозної крові в пробірку з ЕДТА 4 мл.
Забір матеріалу у нас у центрі або можна передати нам пробірку ЕДТА, взяту у будь-якій лабораторії. Про можливість забору у дітей уточнювати додатково.
У наших пунктах забору крім Києва забор матеріалу коштує .
Необхідно надати висновок лікаря з клінічною картиною (опис симтомів, діагноз), заповнити в електронному вигляді анкету.
Аналіз не проводиться для здорових людей без симптомів, у цьому випадку рекомендуються скринінгові аналізи на носійство.
За результатами секвенування необхідно отримати консультацію лікаря-генетика.