Аналізи ДНК в Україні
Всі аналізи/Панелі (секвенування NGS)
Панель Лейкодистрофія та Лейкоенцефалія являє собою панель із 118 генів, яка включає оцінку некодуючих варіантів. Крім того, він також включає успадкований по материнській лінії мітохондріальний геном.
Ідеально підходить для пацієнтів з клінічною підозрою на лейкодистрофію або лейкоенцефалопатію.Гени на цій панелі включені в Розширену панель епілепсії.
Лейкодистрофії є спадковими мієліновими захворюваннями, що вражають білу речовину центральної нервової системи з залученням мієліну периферичної нервової системи або без нього. Лейкодистрофії із встановленою генетичною причиною можуть успадковуватися за аутосомно-домінантним, аутосомно-рецесивним або Х-зчепленим рецесивним типом. Генетична лейкоенцефалопатія передається у спадок і призводить до аномалій білої речовини, але не обов'язково відповідає строгим критеріям лейкодистрофії. Основою діагностики лейкодистрофії та лейкоенцефалопатії є нейровізуалізація. Однак поставити точний діагноз складно, оскільки фенотипи варіабельні, а в одній і тій самій сім'ї можуть бути різні клінічні прояви. Генетичне тестування призводить до розширення спектру фенотипу лейкодистрофій/енцефалопатій. Ці результати підкреслюють критичну важливість генетичного тестування для встановлення клінічного та патологічного діагнозу.
Ген | Асоційований фенотип | Спадкоємність.* | ClinVar** | HGMD** |
---|---|---|---|---|
ABCD1 | Адренолейкодистрофія | XL | 95 | 663 |
ADAR | Симетричний спадковий дисхроматоз, синдром Айкарді-Гутьєра | AD/AR | 25 | 226 |
AIFM1 | Глухота, комбінований дефіцит окисного фосфорилювання 6, синдром Коучка | XL | 27 | 31 |
AIMP1 | Лейкодистрофія, гіпомієлінізуюча | AR | 4 | 5 |
ALDH3A2 | Синдром Шегрена-Ларссона | AR | 74 | 111 |
AP4B1 | Спастична параплегія 47, аутосомно-рецесивний | AR | 17 | 18 |
AP4E1 | Заїкання, сімейне персистуюче, 1, Спастична параплегія 51, аутосомно-рецесивний | AD/AR | 7 | 15 |
AP4M1 | Спастична параплегія 50, аутосомно-рецесивний | AR | 16 | 13 |
AP4S1 | Спастична параплегія 52, аутосомно-рецесивна | AR | 9 | 8 |
APOPT1 | Дефіцит мітохондріального комплексу IV | AR | 4 | 5 |
ARSA | Метахроматична лейкодистрофія | AR | 113 | 246 |
ASPA | Дефіцит аспартоацилази (хвороба Канавана) | AR | 54 | 102 |
CLCN2 | Лейкоенцефалопатія з атаксією, епілепсія | AD/AR | 30 | 36 |
COA7 | Спиноцеребеллярна атаксія, хвороба Шарко-Марі-Тута | AR | 2 | 7 |
COL4A1 | Шизенцефалія, дисгенезія переднього сегмента з ураженням головного мозку, звивистість артерій сітківки, поренцефалія, ангіапатія, спадкова, з нефропатією, аневризмами та м'язовими спазмами, захворювання дрібних судин головного мозку | AD | 58 | 107 |
COX15 | Синдром Лея, кардіоенцефаломіопатія, фатальний немовля, через дефіцит цитохром-с-оксидази | AR | 7 | 5 |
COX6B1 | Дефіцит мітохондріального комплексу IV | AR | 2 | 3 |
CSF1R | Лейкоенцефалопатія, дифузна спадкова, зі сфероїдами | AD | 56 | 83 |
CTC1 | Цереброретинальна мікроангіопатія з кальцифікаціями та кістами | AR | 21 | 33 |
CYP27A1 | Церебротендинозний ксантоматоз | AR | 69 | 110 |
D2HGDH | D-2-гідроксиглутарова ацидурія 1 | AR | 13 | 33 |
DARS | Гіпомієлінізація з ураженням стовбура та спинного мозку та спастичності нижніх кінцівок | AR | 11 | 17 |
DARS2 | Лейкоенцефалопатія з ураженням стовбура головного та спинного мозку та підвищенням лактату | AR | 27 | 61 |
DEGS1 | Лейкодистрофія, гіпомієлінізуюча | AR | ||
EARS2 | Комбінований дефіцит окисного фосфорилювання | AR | 14 | 30 |
EIF2B1 | Лейкоенцефалопатія зі зникненням білої речовини, оваріолейкодистрофія | AD/AR | 7 | 9 |
EIF2B2 | Лейкоенцефалопатія зі зникненням білої речовини, оваріолейкодистрофія | AR | 12 | 28 |
EIF2B3 | Лейкоенцефалопатія зі зникненням білої речовини, оваріолейкодистрофія | AR | 6 | 22 |
EIF2B4 | Лейкоенцефалопатія зі зникненням білої речовини, оваріолейкодистрофія | AR | 8 | 30 |
EIF2B5 | Лейкоенцефалопатія зі зникненням білої речовини, оваріолейкодистрофія | AR | 20 | 98 |
EPRS | Лейкодистрофія, гіпомієлінізуюча | AR | 6 | 6 |
FA2H | Спастична параплегія | AR | 18 | 51 |
FAM126A | Лейкодистрофія, гіпомієлінізуюча | AR | 8 | 12 |
FDX1L | Міопатія | AR | 1 | 2 |
FOLR1 | Церебральний дефіцит фолієвої кислоти | AR | 10 | 28 |
FOXRED1 | Синдром Лея, дефіцит мітохондріального комплексу I | AR | 15 | 8 |
GALC | хвороба Краббе | AR | 107 | 243 |
GFAP | хвороба Олександра | AD | 114 | 131 |
GFM1 | Комбінований дефіцит окисного фосфорилювання | AR | 19 | 19 |
GJC2 | Спастична параплегія, Лімфедема, спадкова, Лейкодистрофія, Гіпомієлінізуюча | AD/AR | 26 | 57 |
HEPACAM | Мегаленцефальна лейкоенцефалопатія з підкірковими кістами, що ремітує | AD/AR | 12 | 26 |
HIBCH | Дефіцит 3-гідроксиізобутрил-КоА-гідролази | AR | 18 | 16 |
HSPD1 | Спастична параплегія, лейкодистрофія, гіпомієлінізуюча | AD/AR | 5 | 5 |
HTRA1 | Церебральна артеріопатія з підкірковими інфарктами та лейкоенцефалопатією 2 типу (CADASIL2), Церебральна аутосомно-рецесивна артеріопатія з підкірковими інфарктами та лейкоенцефалопатією (CARASIL) | AD/AR | 25 | 46 |
IBA57 | Синдром множинних мітохондріальних дисфункцій 3, спастична параплегія 74, аутосомно-рецесивний | AR | 14 | 23 |
L2HGDH | L-2-гідроксиглутарова ацидурія | AR | 15 | 79 |
LMNB1 | Лейкодистрофія, демієлінізуюча, з початком у дорослому віці, аутосомно-домінантна | AD | 2 | 35 |
LYRM7 | Дефіцит мітохондріального комплексу III, ядерний тип 8 | AR | 5 | 9 |
MARS2 | Комбінований дефіцит окисного фосфорилювання | AR | 8 | 5 |
MLC1 | Мегаленцефальна лейкоенцефалопатія з підкірковими кістами | AR | 39 | 108 |
MRPL44 | Комбінований дефіцит окисного фосфорилювання 16 | AR | 2 | 2 |
MT-ATP6 | Нейропатія, атаксія та пігментний ретиніт, спадкова оптична невропатія Лебера, атаксія та полінейропатія, з початком у дорослому віці, кардіоміопатія, інфантильна гіпертрофічна, синдром Лі, стріатонігральна дегенерація, інфантильна, мітохондріальна | Mitochondrial | 19 | |
MT-ATP8 | Кардіоміопатія, апікальна гіпертрофічна та нейропатія, Кардіоміопатія, інфантильна гіпертрофічна | Mitochondrial | 4 | |
MT-CO1 | Міоглобінурія, рецидивна, спадкова оптична нейропатія Лебера, сидеробластна анемія, дефіцит цитохром-С-оксидази, глухота, мітохондріальна | Mitochondrial | 17 | |
MT-CO2 | Дефіцит цитохрому з оксидази | Mitochondrial | 8 | |
MT-CO3 | Дефіцит цитохрому з оксидази, спадкова оптична нейропатія Лебера | Mitochondrial | 9 | |
MT-CYB | Mitochondrial | 69 | ||
MT-ND1 | Мітохондріальна міопатія, енцефалопатія, лактоацидоз та інсультоподібні епізоди, спадкова оптична нейропатія Лебера, атрофія та дистонія зорового нерва Лебера | Mitochondrial | 21 | |
MT-ND2 | Спадкова оптична нейропатія Лебера, дефіцит мітохондріального комплексу I | Mitochondrial | 6 | |
MT-ND3 | Атрофія та дистонія зорового нерва Лебера, дефіцит мітохондріального комплексу I | Mitochondrial | 7 | |
MT-ND4 | Спадкова оптична нейропатія Лебера, атрофія та дистонія зорового нерва Лебера, дефіцит мітохондріального комплексу I | Mitochondrial | 11 | |
MT-ND4L | Спадкова оптична нейропатія Лебера | Mitochondrial | 2 | |
MT-ND5 | Міоклонічна епілепсія з рваними червоними волокнами, мітохондріальна міопатія, енцефалопатія, лактоацидоз та інсультоподібні епізоди, спадкова оптична нейропатія Лебера, дефіцит мітохондріального комплексу I | Mitochondrial | 19 | |
MT-ND6 | Мітохондріальна міопатія, енцефалопатія, лактоацидоз та інсультоподібні епізоди, онкоцитома, спадкова оптична нейропатія Лебера, атрофія та дистонія зорового нерва Лебера, дефіцит мітохондріального комплексу I | Mitochondrial | 16 | |
MT-RNR1 | Глухота, мітохондріальна | Mitochondrial | 3 | |
MT-RNR2 | Токсичність/резистентність до хлорамфеніколу | Mitochondrial | 2 | |
MT-TA | Mitochondrial | 4 | ||
MT-TC | Мітохондріальна міопатія, енцефалопатія, лактоацидоз та інсультоподібні епізоди | Mitochondrial | 3 | |
MT-TD | Mitochondrial | 1 | ||
MT-TE | Діабет-синдром глухоти, Мітохондріальна міопатія, інфантильна, транзиторна, Мітохондріальна міопатія при цукровому діабеті | Mitochondrial | 5 | |
MT-TF | Міоклонічна епілепсія з рваними червоними волокнами, нефропатія, тубулоінтерстиціальна, енцефалопатія, мітохондріальна, епілепсія, мітохондріальна, міопатія, мітохондріальна, мітохондріальна енцефаломіопатія з ілактоацид | Mitochondrial | 7 | |
MT-TG | Mitochondrial | 3 | ||
MT-TH | Mitochondrial | 4 | ||
MT-TI | Mitochondrial | 7 | ||
MT-TK | Міоклонічна епілепсія з рваними червоними волокнами, синдром Лея | Mitochondrial | 5 | |
MT-TL1 | Дефіцит цітохром-с-оксидази, міоклонічна епілепсія з рваними червоними волокнами, мітохондріальна міопатія, енцефалопатія, лактоацидоз та інсультоподібні епізоди, діабет-синдром глухоти, синдром циклічного блювання, СВДС, сприйнятливість | Mitochondrial | 14 | |
MT-TL2 | Мітохондріальне мультисистемне захворювання, прогресуюча зовнішня офтальмоплегія, мітохондріальна міопатія, мітохондріальна енцефаломіопатія з лактоацидозом та інсультоподібними епізодами | Mitochondrial | 5 | |
MT-TM | Синдром Лея, мітохондріальний мультисистемний розлад | Mitochondrial | 1 | |
MT-TN | Прогресуюча зовнішня офтальмоплегія, мітохондріальне мультисистемне захворювання | Mitochondrial | 3 | |
MT-TP | Mitochondrial | 2 | ||
MT-TQ | Мітохондріальний мультисистемний розлад | Mitochondrial | 2 | |
MT-TR | Енцефалопатія, мітохондріальна | Mitochondrial | 2 | |
MT-TS1 | Міоклонічна епілепсія з рваними червоними волокнами, мітохондріальна міопатія, енцефалопатія, лактоацидоз та інсультоподібні епізоди | Mitochondrial | 10 | |
MT-TS2 | Мітохондріальний мультисистемний розлад | Mitochondrial | 2 | |
MT-TT | Mitochondrial | 5 | ||
MT-TV | Гіпертрофічна кардіоміопатія (ГКМП), синдром Лі, мітохондріальне мультисистемне захворювання, мітохондріальна енцефаломіопатія з лактоацидозом та інсультоподібними епізодами | Mitochondrial | 3 | |
MT-TW | Синдром Лі, міопатія, мітохондріальна | Mitochondrial | 8 | |
MT-TY | Мітохондріальний мультисистемний розлад | Mitochondrial | 4 | |
MTFMT | Комбінований дефіцит окисного фосфорилювання 15 | AR | 15 | 16 |
NDUFAF5 | Дефіцит мітохондріального комплексу I | AR | 8 | 12 |
NFU1 | Синдром множинних мітохондріальних дисфункцій 1 | AR | 6 | 15 |
NKX6-2 | Спастична атаксія 8, аутосомно-рецесивна, з гіпомієлінізуючою лейкодистрофією | AR | 4 | 8 |
NOTCH3 | Церебральна артеріопатія з підкірковими інфарктами та лейкоенцефалопатією (CADASIL), синдром латерального менінгоцеле | AD | 87 | 364 |
NT5C2 | Спастична параплегія 45 | AR | 8 | 7 |
NUBPL | Дефіцит мітохондріального комплексу I | AR | 9 | 10 |
PLP1 | Спастична параплегія, хвороба Пелізеуса-Мерцбахера | XL | 60 | 348 |
POLR3A | Лейкодистрофія, гіпомієлінізуюча | AR | 29 | 91 |
POLR3B | Лейкодистрофія, гіпомієлінізуюча | AR | 19 | 58 |
PSAP | Хвороба Краббе, атипова, Метахроматична лейкодистрофія, обумовлена дефіцитом сапозину-В, Комбінована недостатність сапозину, Хвороба Гоше, атипова, обумовлена дефіцитом сапозину С | AR | 18 | 26 |
PYCR2 | Лейкодистрофія, гіпомієлінізуюча 10 | AR | 11 | 13 |
RARS | Лейкодистрофія, гіпомієлінізуюча 9 | AR | 12 | 11 |
RNASEH2A | Синдром Айкарді-Гутьєра | AR | 13 | 21 |
RNASEH2B | Синдром Айкарді-Гутьєра | AR | 16 | 41 |
RNASEH2C | Синдром Айкарді-Гутьєра | AR | 6 | 14 |
RNASET2 | Лейкоенцефалопатія, кістозна, без мегаленцефалії | AR | 8 | 12 |
RNF216 | Мозочкова атаксія та гіпогонадотропний гіпогонадизм (синдром Гордона Холмса) | AR | 10 | 14 |
SAMHD1 | Синдром Айкарді-Гутьєра, озноблений вовчак 2 | AD/AR | 25 | 56 |
SCO1 | Дефіцит мітохондріального комплексу IV | AR | 6 | 5 |
SDHAF1 | Дефіцит мітохондріального комплексу II | AR | 4 | 6 |
SERAC1 | 3-метилглутаконова ацидурія з глухотою, енцефалопатією та Лі-подібним синдромом | AR | 22 | 52 |
SLC1A4 | Спастична тетраплегія, тонке мозолисте тіло та прогресуюча мікроцефалія | AR | 4 | 8 |
SNORD118 | Лейкоенцефалопатія, кальцифікація та кісти головного мозку (синдром Лабрюна) | AR | 6 | 39 |
SOX10 | Периферична демієлінізуюча невропатія, центральна дисмієлінізація, синдром Ваарденбурга та хвороба Гіршпрунга, синдром Каллмана | AD | 56 | 148 |
SUMF1 | Множинний дефіцит сульфатази | AR | 21 | 53 |
TREX1 | Васкулопатія сітківки з церебральною лейкодистрофією, вовчаком обмороження, синдромом Айкарді-Гутьєра | AD/AR | 30 | 71 |
TTC19 | Дефіцит мітохондріального комплексу III, ядерний тип 2 | AR | 13 | 10 |
TUBB4A | Лейкодистрофія, гіпомієлінізуюча, дистонія | AD | 39 | 42 |
ZFYVE26 | Спастична параплегія 15 | AR | 63 | 39 |
* Тип успадкування: аутосомно-домінантний (AD), аутосомно-рецесивний (AR), мітохондріальний (mi), Х-зчеплений (XL), Х-зчеплений домінантний (XLD) та Х-зчеплений рецесивний (XLR); ** ClinVar, HGMD - кількість варіантів гена, класифікованих як патогенні або ймовірно патогенні в базі даних ClinVar, HGMD.
В панель дозволяється додати додаткові гени (до 200), пов'язані з симптомами, та видалити будь-які гени (щоб залишилося не менше 2). Вартість панелі може змінюватися, а саме:
- мала панель 2-25 генів ,
- середня панель 26-125 генів ,
- велика панель понад 126 генів .
Якщо аналіз виявив варіанти, що є можливою причиною хвороби, можна перевірити наявність цих варіантів у батьків. Аналіз окремих мутацій по Сенгеру.
Якщо аналіз не виявив варіантів, які є можливою причиною хвороби, можна розширити тестування до повного екзома Розширення панелі до повного екзома. Крім того, можна отримати сирі дані і робити повторну оцінку кожні кілька років. Можливо, згодом науці стануть відомі нові генетичні чинники захворювання.
Натще не потрібно, рясно пити воду.
Проводиться забір венозної крові в пробірку з ЕДТА 4 мл.
Забір матеріалу у нас у центрі або можна передати нам пробірку ЕДТА, взяту у будь-якій лабораторії. Про можливість забору у дітей уточнювати додатково.
У наших пунктах забору крім Києва забор матеріалу коштує .
Необхідно надати висновок лікаря з клінічною картиною (опис симтомів, діагноз), заповнити в електронному вигляді анкету.
Аналіз не проводиться для здорових людей без симптомів, у цьому випадку рекомендуються скринінгові аналізи на носійство.
За результатами секвенування необхідно отримати консультацію лікаря-генетика.