Аналізи ДНК в Україні
Всі аналізи/Панелі (секвенування NGS)
Панель з 22 генів, що включає оцінку некодуючих варіантів. Ідеально підходить для пацієнтів із заячою губою та/або ущелиною піднебіння, особливо для тих, хто має позитивний сімейний анамнез за ущелинами або має підозру на асоційований генетичний синдром.
Ущелини губ і неба є поширеними вродженими дефектами. Заяча губа з ущелиною піднебіння або без неї зустрічається у 1/700-1/1000 новонароджених, а ущелина неба зустрічається приблизно у 1/1500 новонароджених. Найчастіше виникають як ізольовані вади розвитку, але можуть бути частиною кількох генетичних синдромів чи хромосомних аномалій. Етіологія несиндромальних ущелин залишається погано вивченою, і передбачається багатофакторне успадкування, але в деяких сім'ях схильність до ущелин може йти за аутосомно-домінантним типом успадкування з різною пенетрантністю. Є багато синдромів, які можуть мати ущелини як ознаку. Синдром Ван дер Вуда викликається патогенною мутацією в IRF6 або GRHL3 і характеризується ущелиною губи з ущелиною піднебіння або без неї або ізольованою ущелиною піднебіння та парамедіанними ямками на нижній губі. Це слідує за аутосомно-домінантним наслідуванням, але пенетрантність є неповною. Ущелина неба може бути ознакою синдрому Стиклера, також відомого як спадкова артроофтальмопатія, спадкова вітреоретинопатія, що характеризується асоціацією очних симптомів з аномаліями голови та обличчя, порушеннями кісток та нейросенсорною глухотою. Синдром Стиклера, викликаний мутаціями COL2A1, COL11A1 або COL11A2, успадковується за аутосомно-домінантним типом. Аутосомно-рецесивний синдром Стиклера зустрічається рідко і викликається двоалельними мутаціями в COL9A1, COL9A2 та COL9A3. Синдром Кабукі є синдром множинних вроджених аномалій, що характеризується типовими рисами обличчя, аномаліями скелета, розумовою відсталістю від легкого до помірного ступеня і затримкою постнатального зростання. Інші результати можуть включати ущелини губи та/або піднебіння. Синдром Кабукі викликається мутаціями у KMT2D або KDM6A.
Ген | Асоційований фенотип | Спадкоємність.* | ClinVar** | HGMD** |
---|---|---|---|---|
ARHGAP29 | AD | 3 | 19 | |
COL11A1 | Синдром Маршалла, фіброхондрогенез, синдром Стиклера 2 типу | AD/AR | 34 | 94 |
COL11A2 | синдром Вейсенбахера-Цвеймюллера, глухота, отоспондиломегаепіфізарна дисплазія, фіброхондрогенез, синдром Стиклера 3 типу (неокулярний) | AD/AR | 29 | 57 |
COL2A1 | Аваскулярний некроз головки стегнової кістки, регматогенне відшарування сітківки, епіфізарна дисплазія з міопією та глухотою, чеська дисплазія, ахондрогенез 2 типу, платиспондилічна дисплазія типу Торранса, гіпохондрогенез, вроджена спонди спондилоепімететафізарна дисплазія (СЕМД) типу Струдвіка, дисплазія Кніста, Спондилопериферична дисплазія, СЕД легкого ступеня з передчасним початком артрозу, СЕД з укороченням плеснових кісток, синдром Стіклера 1 типу | AD | 180 | 561 |
COL9A1 | Множинна епіфізарна дисплазія 6 типу (ЕДМ6), синдром Стіклера, тип IV | AD/AR | 9 | 6 |
COL9A2 | Синдром Стиклера, множинна епіфізарна дисплазія 2 типу (EDM2) | AD/AR | 7 | 12 |
COL9A3 | Множинна епіфізарна дисплазія 3 типу (ЕДМ3), рецесивний тип синдрому Стиклера | AD/AR | 10 | 14 |
CTNND1 | Блефарохейлодонтичний синдром 2, Заяча губа | AD | 4 | 16 |
FOXE1 | Рак щитовидної залози, немедулярний 4, Гіпотиреоз, тиреоїдний, з колючим волоссям та ущелиною неба (синдром Бемфорта-Лазаруса), Вроджений гіпотиреоз | AD/AR | 4 | 23 |
GRHL3 | синдром ван дер Вуда 2 | AD | 12 | 27 |
IRF6 | Орофаціальна ущелина, синдром підколінного птеригіуму, синдром Ван дер Вуда | AD | 45 | 338 |
KDM6A | Синдром Кабукі | XL | 40 | 69 |
KMT2D | Синдром Кабукі | AD | 350 | 670 |
MSX1 | Орофаціальна ущелина 5, Агенезія зубів, селективна, 1, з/без орофаціальної ущелини, синдром Віткопа | AD | 11 | 48 |
SATB2 | Синдром скла | AD | 62 | 106 |
SPECC1L | Ущелина особи, коса, 1, синдром Opitz GBBB, тип II | AD | 7 | 8 |
TBX2 | AD | 1 | 12 | |
TBX22 | Ущелина неба з анкілоглосією або без неї | XL | 12 | 29 |
TGDS | синдром Катель-Манцке | AR | 6 | 7 |
TP63 | Синдром Раппа-Ходжкіна, Орофаціальна ущелина, Дорослий синдром, Ектродактилія, ектодермальна дисплазія та синдром ущелини губи/піднебіння, Анкілоблефарон-ектодермальні дефекти-заяча губа/піднебіння, Розщеплена-> | AD | 59 | 122 |
TXNL4A | Синдром Берна-МакКеуна | AR | 19 | 13 |
ZSWIM6 | Акрометичний лобово-носовий дизостоз | AD | 4 | 2 |
* Тип успадкування: аутосомно-домінантний (AD), аутосомно-рецесивний (AR), мітохондріальний (mi), Х-зчеплений (XL), Х-зчеплений домінантний (XLD) та Х-зчеплений рецесивний (XLR); ** ClinVar, HGMD - кількість варіантів гена, класифікованих як патогенні або ймовірно патогенні в базі даних ClinVar, HGMD.
В панель дозволяється додати додаткові гени (до 200), пов'язані з симптомами, та видалити будь-які гени (щоб залишилося не менше 2). Вартість панелі може змінюватися, а саме:
- мала панель 2-25 генів ,
- середня панель 26-125 генів ,
- велика панель понад 126 генів .
Якщо аналіз виявив варіанти, що є можливою причиною хвороби, можна перевірити наявність цих варіантів у батьків. Аналіз окремих мутацій по Сенгеру.
Якщо аналіз не виявив варіантів, які є можливою причиною хвороби, можна розширити тестування до повного екзома Розширення панелі до повного екзома. Крім того, можна отримати сирі дані і робити повторну оцінку кожні кілька років. Можливо, згодом науці стануть відомі нові генетичні чинники захворювання.
Натще не потрібно, рясно пити воду.
Проводиться забір венозної крові в пробірку з ЕДТА 4 мл.
Забір матеріалу у нас у центрі або можна передати нам пробірку ЕДТА, взяту у будь-якій лабораторії. Про можливість забору у дітей уточнювати додатково.
У наших пунктах забору крім Києва забор матеріалу коштує .
Необхідно надати висновок лікаря з клінічною картиною (опис симтомів, діагноз), заповнити в електронному вигляді анкету.
Аналіз не проводиться для здорових людей без симптомів, у цьому випадку рекомендуються скринінгові аналізи на носійство.
За результатами секвенування необхідно отримати консультацію лікаря-генетика.