Аналізи ДНК в Україні
Всі аналізи/Панелі (секвенування NGS)
Панель зі 100 генів, що включає оцінку варіантів, що не кодують. Ідеально підходить для пацієнтів із клінічною підозрою на низьке зростання та пов'язані з ним розлади.
Клінічні фенотипи розладів, що охоплюються цією панеллю, варіюються за тяжкістю затримки росту та мікроцефалії, а також за ступенем затримки розвитку, але між синдромами може бути значний клінічний збіг. захворювань, пов'язаних з низьким зростанням, таких як затримка зростання через резистентності до інсуліноподібного фактора росту I або дефіциту IGF1 (мутації в IGF1R і IGF1), гіпотиреоз через дефіцитні транскрипційні фактори, що беруть участь у розвитку або функціонуванні гіпофіза (HESX1, LHX3, LHX4, P1 (CREBBP і EP300), синдрому Корнелії де Ланге (NIPBL, RAD21, SMC3, HDAC8 і SMC1A) та різних форм непропорційно низького росту. мутація FGFR3) є найбільш поширеною формою непропорційної затримки росту, її частота оцінюється приблизно в 1/25 000 живороджень у всьому світі. групі ризику Наприклад, пацієнта чоловічої статі із синдромом 3-М необхідно буде спостерігати на предмет розвитку гіпогонадизму. На підставі генетичних досліджень у дітей з вираженою низькорослістю неясної етіології висловлено припущення, що моногенні причини низькорослості недостатньо діагностуються в дитячій ендокринній клініці. гормону росту, малий розмір для гестаційного віку без відставання у зростанні, додаткові вроджені аномалії чи дисморфічні особливості, пов'язані з цим розумова відсталість, мікроцефалія та зростання нижче –3SD (стандартних відхилень).
Ген | Асоційований фенотип | Спадкоємність.* | ClinVar** | HGMD** |
---|---|---|---|---|
ACTB | Синдром Барайцера-Вінтера | AD | 55 | 60 |
ACTG1 | Глухота, синдром Барайцера-Вінтера. | AD | 27 | 47 |
AMMECR1 | Гіпоплазія середньої зони обличчя, порушення слуху, еліптоцитоз та нефрокальциноз. | XL | 4 | 5 |
ARCN1 | Ризомелічна низькорослість з мікроцефалією, мікрогнатією та затримкою розвитку (SRMMD) | AD | 3 | 3 |
ATR | Кожна телеангіектазія та раковий синдром, синдром Секкеля | AD/AR | 10 | 33 |
B3GAT3 | Множинні вивихи суглобів, низьке зростання, черепно-лицевий дисморфізм та вроджені вади серця | AR | 6 | 13 |
BCS1L | Синдром Бйорнстада, синдром GRACILE, синдром Лі, дефіцит мітохондріального комплексу III, ядерний тип 1 | AR | 42 | 37 |
BLM | Синдром Блума | AR | 152 | 119 |
BMP2 | Брахідактилія типу А2 | AD | 5 | 28 |
BRAF | Синдром LEOPARD, синдром Нунан, кардіофаціально-шкірний синдром | AD | 134 | 65 |
CBL | Розлад, подібний до синдрому Нунан, з ювенільним мієломоноцитарним лейкозом або без нього | AD | 24 | 43 |
CCDC8 | Синдром трьох М3 | AR | 2 | 3 |
CDC45 | Синдром Меєра-Горліна 7 | AR | 10 | 19 |
CDC6 | Синдром Мейєра-Горліна (синдром вуха-надколінка-низького зростання) | AR | 2 | 2 |
CDT1 | Синдром Мейєра-Горліна (синдром вуха-надколінка-низького зростання) | AR | 6 | 12 |
CENPJ | синдром Секкеля, мікроцефалія | AR | 34 | 9 |
CEP152 | синдром Секкеля, мікроцефалія | AR | 20 | 20 |
CEP63 | синдром Секкеля | AR | 7 | 2 |
COL27A1 | Сталевий синдром | AR | 7 | 7 |
CREBBP | Синдром Рубінштейна-Тайбі | AD | 175 | 362 |
CUL7 | Синдром 3-М, синдром якутської низькорослості | AR | 26 | 83 |
DHCR7 | Синдром Сміта-Лемлі-Опитца | AR | 88 | 217 |
DONSON | Мікроцефалія, низьке зростання та аномалії кінцівок (MISSLA), синдром мікроцефалії-мікромелії | AR | 10 | 19 |
EP300 | Синдром Рубінштейна-Тайбі | AD | 63 | 101 |
FGD1 | Синдром Аарскога-Скотта, Розумна відсталість, синдромальний | XL | 29 | 51 |
FGFR3 | Лакрімоаурікулодентодигітальний синдром, синдром Мюнке, синдром Крузона з чорним акантозом, синдром камптодактилії, високого росту та втрати слуху (CATSHL), ахондроплазія, гіпохондроплазія, танатофорна дисплазія 1 типу, танатофорна дисплазія 2 | AD/AR | 54 | 77 |
FN1 | Гломерулопатія з відкладеннями фібронектину 2 | AD | 14 | 25 |
GH1 | Ізольований дефіцит гормону росту, синдром Коварського | AD/AR | 25 | 90 |
GHR | Синдром нечутливості до гормону росту (синдром Ларона) | AD/AR | 35 | 115 |
GHRHR | Ізольований дефіцит гормону росту | AR | 13 | 51 |
GHSR | Невисоке зростання | AD/AR | 2 | 12 |
GLI2 | Синдром Каллера-Джонса | AD | 29 | 82 |
GNAS | Синдром МакКьюна-Олбрайта, Прогресуюча кісткова гетероплазія, Псевдогіпопаратиреоз, Спадкова остеодистрофія Олбрайта | AD | 64 | 274 |
HDAC8 | Синдром Корнелії де Ланге | XL | 41 | 50 |
HESX1 | Септооптична дисплазія, Дефіцит гормонів гіпофіза, комбінований, Ізольований дефіцит гормону росту | AR/AD | 15 | 26 |
HRAS | Синдром Костелло, вроджена міопатія з надлишком м'язових веретен. | AD | 43 | 31 |
IDUA | Мукополісахаридоз | AR | 105 | 282 |
IGF1 | Дефіцит інсуліноподібного фактора зростання I | AD/AR | 4 | 8 |
IGF1R | Інсуліноподібний фактор росту I, резистентність | AD/AR | 12 | 64 |
IGFALS | Білок, що зв'язує інсуліноподібний фактор росту, кислотолабільна субодиниця, дефіцит | AR | 5 | 34 |
INSR | Гіперінсулінемічна гіпоглікемія, сімейна, синдром Рабсона-Менденхолла, синдром Донохо | AD/AR | 44 | 190 |
IRS1 | Цукровий інсуліннезалежний діабет | AD/AR | 3 | 17 |
KRAS | Синдром Нунан, Кардіофаціо-шкірний синдром | AD | 63 | 35 |
LARP7 | синдром Алазамі | AR | 19 | 10 |
LFNG | Спонділокостальний дизостоз, аутосомно-рецесивний тип 3 | AR | 1 | 5 |
LHX3 | Дефіцит гормонів гіпофіза, комбінований | AR | 9 | 16 |
LHX4 | Дефіцит гормонів гіпофіза, комбінований | AD | 10 | 23 |
LZTR1 | Шванноматоз, синдром Нунан | AD/AR | 34 | 71 |
MAP2K1 | Кардіофаціо-шкірний синдром | AD | 45 | 23 |
MAP2K2 | Кардіофаціо-шкірний синдром | AD | 21 | 35 |
NIPBL | Синдром Корнелії де Ланге | AD | 311 | 425 |
NOTCH2 | Синдром Алажиля, синдром Хайду-Чейні | AD | 37 | 70 |
NRAS | Сіндром Нунан | AD | 31 | 14 |
OBSL1 | синдром 3-М | AR | 13 | 33 |
ORC1 | Синдром Мейєра-Горліна (синдром вуха-надколінка-низького зростання) | AR | 9 | 10 |
ORC4 | Синдром Мейєра-Горліна (синдром вуха-надколінка-низького зростання) | AR | 24 | 6 |
ORC6 | Синдром Мейєра-Горліна (синдром вуха-надколінка-низького зростання) | AR | 7 | 6 |
OSGEP | Синдром Галлоуея-Мовата | AR | 11 | 17 |
OTX2 | Мікрофтальмія синдромальна, недостатність гормонів гіпофіза, комбінована, дистрофія сітківки, ранній початок, дисфункція гіпофіза | AD | 23 | 73 |
PCNT | Мікроцефальна остеодиспластична первинна карликовість | AR | 49 | 88 |
PISD | AR | |||
PITX2 | синдром Аксенфельда-Рігера, кільцевий дермоїд рогівки, іридогоніодісгенез, аномалія Петерса | AD | 23 | 101 |
POC1A | Низьке зростання, оніходисплазія, дисморфізм обличчя та гіпотрихоз (синдром SOFT). | AR | 4 | 8 |
POP1 | Анаукетична дисплазія 2 | AR | 5 | 6 |
POU1F1 | Дефіцит гормонів гіпофіза, комбінований | AR | 20 | 41 |
PPP3CA | Епілептична енцефалопатія | AD | 8 | 11 |
PRMT7 | Низьке зростання, брахідактилія, порушення розумового розвитку та судоми (SBIDDS) | AR | 10 | 11 |
PROP1 | Дефіцит гормонів гіпофіза, комбінований | AR | 33 | 37 |
PTPN11 | синдром Нунан, метахондроматоз | AD | 135 | 140 |
PUF60 | Низьке зростання, мікроцефалія. | AD | 24 | 30 |
RAD21 | Синдром Корнелії де Ланге 4 | AD | 14 | 11 |
RAF1 | Синдром LEOPARD, синдром Нунан, дилатаційна кардіоміопатія (ДКМП) | AD | 45 | 53 |
RALA | Порушення інтелектуального розвитку | AD | 1 | |
RASA2 | Сіндром Нунан | AD | 1 | 3 |
RBBP8 | синдром Секкеля, синдром Джаваду | AR | 6 | 6 |
RIT1 | Сіндром Нунан | AD | 23 | 26 |
RNU4ATAC | Синдром Ройфмана, мікроцефальна остеодиспластична примордіальна карликовість 1 типу, мікроцефальна остеодиспластична первинна карликовість 3 типу | AR | 15 | 24 |
RRAS | Нунан-синдром, подібний до фенотипу | AD/AR | 2 | |
RTTN | Мікроцефалія, низьке зростання та полімікрогірія з судомами або без них. | AR | 16 | 16 |
SGMS2 | Остеопороз та остеопоротічні переломи, Скелетна дисплазія та порушення | AD | ||
SHOC2 | Нунан-подібний синдром з випаданням анагенного волосся. | AD | 2 | 4 |
SHOX | Дисхондростеоз Лері-Вейля, мезомелічна дисплазія Лангера, низьке зростання | XL/PAR | 25 | 431 |
SMARCA2 | Синдром Ніколаїдеса-Барайтсера | AD | 41 | 73 |
SMARCE1 | Синдром Гробу-Сірісу | AD | 14 | 12 |
SMC1A | Синдром Корнелії де Ланге | XL | 73 | 87 |
SMC3 | Синдром Корнелії де Ланге | AD | 25 | 21 |
SOS1 | Сіндром Нунан | AD | 44 | 71 |
SOX11 | Порушення інтелектуального розвитку з мікроцефалією та вадами розвитку очей або без них або гіпогонадотропним гіпогонадизмом. | AD | 11 | 14 |
SOX2 | Мікрофтальмія синдромальна | AD | 34 | 104 |
SOX3 | Пангіпопітуітаризм | XL | 4 | 26 |
SRCAP | Синдром Флаат-Харбора | AD | 16 | 43 |
STAT5B | Нечутливість до гормону росту при імунодефіциті | AD/AR | 9 | 13 |
TALDO1 | Дефіцит трансальдолази | AR | 6 | 10 |
TBX19 | Дефіцит адренокортикотропного гормону | AR | 12 | 27 |
TBX2 | AD | 1 | 12 | |
TBX3 | Ульнарно-мамарний синдром | AD | 6 | 20 |
TOP3A | AR | 8 | ||
TRIM37 | Мулібрей нанизм | AR | 19 | 23 |
TRMT10A | Мікроцефалія, низьке зростання та порушення метаболізму глюкози 1 | AR | 2 | 7 |
XRCC4 | Низьке зростання, мікроцефалія та ендокринна дисфункція. | AR | 9 | 10 |
* Тип успадкування: аутосомно-домінантний (AD), аутосомно-рецесивний (AR), мітохондріальний (mi), Х-зчеплений (XL), Х-зчеплений домінантний (XLD) та Х-зчеплений рецесивний (XLR); ** ClinVar, HGMD - кількість варіантів гена, класифікованих як патогенні або ймовірно патогенні в базі даних ClinVar, HGMD.
В панель дозволяється додати додаткові гени (до 200), пов'язані з симптомами, та видалити будь-які гени (щоб залишилося не менше 2). Вартість панелі може змінюватися, а саме:
- мала панель 2-25 генів ,
- середня панель 26-125 генів ,
- велика панель понад 126 генів .
Якщо аналіз виявив варіанти, що є можливою причиною хвороби, можна перевірити наявність цих варіантів у батьків. Аналіз окремих мутацій по Сенгеру.
Якщо аналіз не виявив варіантів, які є можливою причиною хвороби, можна розширити тестування до повного екзома Розширення панелі до повного екзома. Крім того, можна отримати сирі дані і робити повторну оцінку кожні кілька років. Можливо, згодом науці стануть відомі нові генетичні чинники захворювання.
Натще не потрібно, рясно пити воду.
Проводиться забір венозної крові в пробірку з ЕДТА 4 мл.
Забір матеріалу у нас у центрі або можна передати нам пробірку ЕДТА, взяту у будь-якій лабораторії. Про можливість забору у дітей уточнювати додатково.
У наших пунктах забору крім Києва забор матеріалу коштує .
Необхідно надати висновок лікаря з клінічною картиною (опис симтомів, діагноз), заповнити в електронному вигляді анкету.
Аналіз не проводиться для здорових людей без симптомів, у цьому випадку рекомендуються скринінгові аналізи на носійство.
За результатами секвенування необхідно отримати консультацію лікаря-генетика.