Аналізи ДНК в Україні
Всі аналізи/Панелі (секвенування NGS)
В панель "Панкреатит" входить 9 генів, також включена оцінка некодуючих варіантів, виявлення делецій та дуплікацій.
Ідеальна панель для пацієнтів із клінічною підозрою на гострий панкреатит, хронічний панкреатит або рецидивний хронічний панкреатит.
Панкреатит характеризується епізодами запалення підшлункової залози, що повторюються. У більшості випадків панкреатит виникає у пацієнтів з відомими факторами ризику, такими як тривале або гостре зловживання алкоголем, але деякі пацієнти не мають очевидної причини захворювання. При ідіопатичному і спадковому панкреатиті симптоми зазвичай починаються в пізньому дитинстві з епізоду гострого панкреатиту. Рецидивуючий гострий панкреатит призводить до хронічного панкреатиту через стійке запалення, що викликає незворотне пошкодження тканин та втрату ендокринної та екзокринної функції підшлункової залози. Хронічний панкреатит збільшує ризик розвитку діабету та раку підшлункової залози, особливо при курінні та вживанні алкоголю. Генетичне тестування допомагає класифікувати тип панкреатиту, тобто ідіопатичний або спадковий, а також допомагає у диференціальній діагностиці хронічного панкреатиту від інших захворювань, таких як синдром Швахмана-Даймонда та синдром Йохансона-Бліззарда, які також можуть виявлятися панкреатитом. Поширеність спадкового панкреатиту оцінюється в 0,3-1,4/100 000 у країнах, а дефектний ген PRSS1 виявляється у 60-80% випадків (PMID 20502448). Зустрічається екзокринної та ендокринної недостатності підшлункової залози та ризик раку підшлункової залози вищий серед пацієнтів зі спадковим панкреатитом (мутації PRSS1) порівняно з пацієнтами з ідіопатичним панкреатитом або панкреатитом, пов'язаним з варіантами CFTR або SPINK1.
Ген | Асоційований фенотип | Спадкоємність.* | ClinVar** | HGMD** |
---|---|---|---|---|
APOA5 | Гіперхіломікронемія | AD/AR | 3 | 61 |
APOC2 | Гіперліпопротеїнемія Ib типу | AR | 13 | 22 |
CFTR | Муковісцидоз, Природжена двостороння відсутність сім'явивідних проток. | AD/AR | 518 | 1803 |
CPA1 | Спадковий хронічний панкреатит | AD/AR | 41 | |
CTRC | Спадковий хронічний панкреатит, Тропічний панкреатит | AD/AR | 11 | 44 |
GPIHBP1 | Hyperlipoproteinemia, type ID | AR | 10 | 31 |
PRSS1 | Спадковий панкреатит | AD | 23 | 62 |
SPINK1 | Спадковий панкреатит | AD | 14 | 48 |
UBR1 | синдром Йохансона-Близзарда | AR | 11 | 71 |
* Тип успадкування: аутосомно-домінантний (AD), аутосомно-рецесивний (AR), мітохондріальний (mi), Х-зчеплений (XL), Х-зчеплений домінантний (XLD) та Х-зчеплений рецесивний (XLR); ** ClinVar, HGMD - кількість варіантів гена, класифікованих як патогенні або ймовірно патогенні в базі даних ClinVar, HGMD.
В панель дозволяється додати додаткові гени (до 200), пов'язані з симптомами, та видалити будь-які гени (щоб залишилося не менше 2). Вартість панелі може змінюватися, а саме:
- мала панель 2-25 генів ,
- середня панель 26-125 генів ,
- велика панель понад 126 генів .
Якщо аналіз виявив варіанти, що є можливою причиною хвороби, можна перевірити наявність цих варіантів у батьків. Аналіз окремих мутацій по Сенгеру.
Якщо аналіз не виявив варіантів, які є можливою причиною хвороби, можна розширити тестування до повного екзома Розширення панелі до повного екзома. Крім того, можна отримати сирі дані і робити повторну оцінку кожні кілька років. Можливо, згодом науці стануть відомі нові генетичні чинники захворювання.
Натще не потрібно, рясно пити воду.
Проводиться забір венозної крові в пробірку з ЕДТА 4 мл.
Забір матеріалу у нас у центрі або можна передати нам пробірку ЕДТА, взяту у будь-якій лабораторії. Про можливість забору у дітей уточнювати додатково.
У наших пунктах забору крім Києва забор матеріалу коштує .
Необхідно надати висновок лікаря з клінічною картиною (опис симтомів, діагноз), заповнити в електронному вигляді анкету.
Аналіз не проводиться для здорових людей без симптомів, у цьому випадку рекомендуються скринінгові аналізи на носійство.
За результатами секвенування необхідно отримати консультацію лікаря-генетика.