Аналізи ДНК в Україні
Всі аналізи/Панелі (секвенування NGS)
В панель Недосконалий остеогенез входить 33 гени, також включена оцінка некодуючих варіантів, виявлення делецій та дуплікацій. Гени цієї панелі входять до Розширену панель порушень скелета.
Ідеальна панель для пацієнтів з клінічною підозрою на Недосконалий остеогенез або споріднене захворювання.
Фенотип недосконалого остеогенезу варіює від остеопорозу, що проявляється у дорослому віці, до летальності у дитинстві. На дві найлегші форми, класичний недеформуючий недосконалий остеогенез і поширений варіабельний недосконалий остеогенез, припадає значно більше половини всіх випадків хвороби. Близько 90% пацієнтів мають мутації у генах колагену I типу (COL1A1 та COL1A2). Недосконалий остеогенез, пов'язаний з COL1A1/2, успадковується за аутосомно-домінантним типом. Нещодавно ідентифіковано кілька додаткових генів. Первинним диференціальним діагнозом для осіб з ознаками недосконалого остеогенезу, пов'язаного з COL1A1/2 є аутосомно-рецесивні підтипи недосконалого остеогенезу. Частка випадків, викликаних мутацією de novo COL1A1 або COL1A2, залежить від тяжкості захворювання: приблизно 60% випадків класичного недеформуючого недосконалого остеогенезу з блакитними склерами або звичайного варіабельного недосконалого остеогенезу з нормальними склерами, практично 100 і майже 100% прогресивно деформованих недосконалого остеогенезу виникають de novo. Гонадний мозаїцизм може бути у 3-5% випадків. Поширеність захворювання становить приблизно 6-7:100 000. Основним клінічним проявом є крихкість кістяка. Можуть бути деформація скелета, низьке зростання, сколіоз та черв'ячні кістки. Інші позаскелетні прояви можуть включати втрату слуху, недосконалий дентиногенез, блакитні/сірі склери, гіперкальціурію, легку кровоточивість, підвищену в'ялість зв'язок, шкірні та серцево-судинні аномалії. Диференціальний діагноз включає рахіт, остеомаляцію та інші рідкісні скелетні синдроми. Ми включили гени гіпофосфатазії на цю панель у диференційно-діагностичних цілях. Ми також включили гени для деяких синдромів/розладів, при яких остеопенія/переломи є одним із результатів диференціальної діагностики у випадках з обмеженою клінічною інформацією, наприклад, у новонароджених.
Ген | Асоційований фенотип | Спадкоємність.* | ClinVar** | HGMD** |
---|---|---|---|---|
ALPL | Одонтогіпофосфатазія, гіпофосфатазія перинатальна летальна, інфантильна, ювенільна та доросла форми | AD/AR | 78 | 291 |
ARCN1 | Ризомелічна низькорослість з мікроцефалією, мікрогнатією та затримкою розвитку (SRMMD) | AD | 3 | 3 |
B3GAT3 | Множинні вивихи суглобів, низьке зростання, черепно-лицевий дисморфізм та вроджені вади серця | AR | 6 | 13 |
B4GALT7 | Синдром Елерса-Данлоса, прогероїдна форма | AR | 8 | 9 |
BMP1 | Недосконалий остеогенез | AR | 7 | 21 |
CLCN5 | Протеїнурія, низькомолекулярна, з гіперкальціуричним нефрокальцинозом, Гіпофосфатемічний рахіт, Нефролітіаз, I, Хвороба Дента | XL | 48 | 272 |
COL1A1 | Синдром Елерса-Данлоса, хвороба Каффі, недосконалий остеогенез 1 типу, недосконалий остеогенез 2 типу, недосконалий остеогенез 3 типу, недосконалий остеогенез 4 типу | AD | 352 | 962 |
COL1A2 | Синдром Елерса-Данлоса, клапанна форма серця, недосконалий остеогенез 1 типу, недосконалий остеогенез 2 типу, недосконалий остеогенез 3 типу, недосконалий остеогенез 4 типу | AD/AR | 186 | 509 |
CREB3L1 | Недосконалий остеогенез, тип XVI | AR | 2 | 3 |
CRTAP | Недосконалий остеогенез 2 типу, Недосконалий остеогенез 3 типу, Недосконалий остеогенез 4 типу | AR | 12 | 30 |
FAM46A | Недосконалий остеогенез | AR | 3 | 3 |
FGF23 | Пухлинний кальциноз, гіперфосфатемічний, гіпофосфатемічний рахіт | AD/AR | 10 | 17 |
FKBP10 | Синдром Бруку 1, недосконалий остеогенез, тип XI | AR | 20 | 44 |
IFITM5 | Недосконалий остеогенез 5 типу | AD | 2 | 2 |
LRP5 | Хвороба Ван Бюхема, синдром остеопорозу-псевдогліоми, гіперостоз, ендостальний, остеосклероз, ексудативна вітреоретинопатія, пізня форма остеопетрозу 1 типу, первинний остеопороз LRP5 | AD/AR/Digenic | 57 | 196 |
MBTPS2 | Декальвуючий фолікулярний шиповидний кератоз, синдром IFAP, долонно-підошовна кератодермія, що калічать, з періорифіціальними кератотичними бляшками | XL | 12 | 25 |
P3H1 | Недосконалий остеогенез | AR | 18 | 63 |
P4HB | Синдром Коула Карпентера 1 | AD | 1 | 11 |
PHEX | Гіпофосфатемічний рахіт | XL | 263 | 437 |
PLOD2 | Синдром Брука, недосконалий остеогенез 3 типу | AR | 8 | 23 |
PLS3 | Остеопороз та остеопоротичні переломи | XL | 1 | 17 |
PPIB | Недосконалий остеогенез 2 типу, Недосконалий остеогенез 3 типу, Недосконалий остеогенез 4 типу | AR | 8 | 13 |
SEC24D | Синдром Коула-Карпентера 2 | AR | 4 | 12 |
SERPINF1 | Недосконалий остеогенез, тип VI | AR | 9 | 41 |
SERPINH1 | Недосконалий остеогенез 3 типу | AR | 3 | 6 |
SGMS2 | Остеопороз та остеопорозні переломи, Скелетна дисплазія та порушення | AD | ||
SLC29A3 | Гістіоцитоз-лімфаденопатія плюс синдром, Дизостеосклероз | AR | 17 | 25 |
SLC34A3 | Гіпофосфатемічний рахіт з гіперкальціурією | AR | 22 | 38 |
SP7 | Недосконалий остеогенез XII типу. | AR | 2 | 3 |
SPARC | Кератоконус, недосконалий остеогенез, XVII тип | AR | 2 | 4 |
TAPT1 | 2 | 3 | ||
TMEM38B | Недосконалий остеогенез, тип XIV | AR | 2 | 7 |
WNT1 | Остеопитування, аутосомно-домінантний, недосконалий остеогенез, тип XV | AD/AR | 9 | 40 |
* Тип успадкування: аутосомно-домінантний (AD), аутосомно-рецесивний (AR), мітохондріальний (mi), Х-зчеплений (XL), Х-зчеплений домінантний (XLD) та Х-зчеплений рецесивний (XLR); ** ClinVar, HGMD - кількість варіантів гена, класифікованих як патогенні або ймовірно патогенні в базі даних ClinVar, HGMD.
В панель дозволяється додати додаткові гени (до 200), пов'язані з симптомами, та видалити будь-які гени (щоб залишилося не менше 2). Вартість панелі може змінюватися, а саме:
- мала панель 2-25 генів ,
- середня панель 26-125 генів ,
- велика панель понад 126 генів .
Якщо аналіз виявив варіанти, що є можливою причиною хвороби, можна перевірити наявність цих варіантів у батьків. Аналіз окремих мутацій по Сенгеру.
Якщо аналіз не виявив варіантів, які є можливою причиною хвороби, можна розширити тестування до повного екзома Розширення панелі до повного екзома. Крім того, можна отримати сирі дані і робити повторну оцінку кожні кілька років. Можливо, згодом науці стануть відомі нові генетичні чинники захворювання.
Натще не потрібно, рясно пити воду.
Проводиться забір венозної крові в пробірку з ЕДТА 4 мл.
Забір матеріалу у нас у центрі або можна передати нам пробірку ЕДТА, взяту у будь-якій лабораторії. Про можливість забору у дітей уточнювати додатково.
У наших пунктах забору крім Києва забор матеріалу коштує .
Необхідно надати висновок лікаря з клінічною картиною (опис симтомів, діагноз), заповнити в електронному вигляді анкету.
Аналіз не проводиться для здорових людей без симптомів, у цьому випадку рекомендуються скринінгові аналізи на носійство.
За результатами секвенування необхідно отримати консультацію лікаря-генетика.