Аналізи ДНК в Україні
Всі аналізи/Панелі (секвенування NGS)
В панель "Нефролітіаз (нирковокам'яна хвороба)" входить 45 генів, також включена оцінка некодуючих варіантів, виявлення делецій та дуплікацій.
Нефролітіаз (нирковокам'яна хвороба) є частим захворюванням з поширеністю від 5 до 10% у загальній популяції. Зазвичай це пов'язано з метаболічними порушеннями, які можуть включати гіперкальціурію, гіперфосфатурію, гіпероксалурію, гіпоцитратурію, гіперурикозурію, цистинурію, низький об'єм сечі та дефект підкислення сечі. Вважається, що генетичні чинники, і навіть чинники довкілля сприяють його патогенезу. Гіперкальціуричний нефролітіаз є сімейним захворюванням більш ніж у 35% пацієнтів. Моногенні форми гіперкальціуричного нефролітіазу включають синдром Барттера, хворобу Дента, аутосомно-домінантну гіпокальціємічну гіперкальціурію, гіперкальціуричний нефролітіаз з гіпофосфатемією та сімейну гіпомагніємію з гіперкальціурією. Гени, пов'язані з нефролітіазом, кодують білки, включаючи ряд транспортерів, каналів та рецепторів, які беруть участь у регуляції реабсорбції кальцію, фосфатів у ниркових канальцях та активності інгібіторів преципітації. Більшість (від 65% до 75%) каменів складаються або з чистих, або в основному із солей кальцію, у тому числі з оксалату кальцію, суміші оксалату кальцію з сечовою кислотою та фосфату кальцію (кидається). Решту каменів складають сечова кислота, цистин і фосфат магнію-амонію (струвіт). Склад каменю відбиває метаболічні порушення у сечі. Лікування ґрунтується на діагнозі, і генетичне тестування може допомогти, оскільки біохімічне тестування зазвичай не призводить до точного молекулярного діагнозу. Екологічні та особливо дієтичні фактори важливі як для первинної, так і для вторинної профілактики.
Ген | Асоційований фенотип | Спадкоємність.* | ClinVar** | HGMD** |
---|---|---|---|---|
ADCY10 | Абсорбційна гіперкальціурія | AD | 6 | |
AGXT | Гіпероксалурія | AR | 190 | 205 |
ALPL | Одонтогіпофосфатазія, гіпофосфатазія перинатальна летальна, інфантильна, ювенільна та доросла форми | AD/AR | 78 | 291 |
APRT | Дефіцит аденінфосфорибозилтрансферази | AR | 11 | 47 |
ATP6V0A4 | Нірковий тубулярний ацидоз, дистальний | AR | 16 | 84 |
ATP6V1B1 | Нірковий тубулярний ацидоз із глухотою | AR | 15 | 56 |
ATP7B | хвороба Вільсона | AR | 219 | 897 |
BSND | Нейросенсорна глухота з легкою нирковою дисфункцією, синдром Барттера | AR | 10 | 20 |
CA2 | Остеопетроз з ацидозом ниркових канальців | AR | 9 | 31 |
CASR | Гіпокальціємія, неонатальний гіперпаратиреоз, сімейна гіпокальціурична гіперкальціємія з транзиторним неонатальним гіперпаратиреозом | AD/AR | 104 | 396 |
CLCN5 | Протеїнурія, низькомолекулярна, з гіперкальціуричним нефрокальцинозом, Гіпофосфатемічний рахіт, Нефролітіаз, I, Хвороба Дента | XL | 48 | 272 |
CLCNKA | синдром Бартеру | AR/Digenic | 3 | 3 |
CLCNKB | синдром Бартеру | AR/Digenic | 19 | 119 |
CLDN16 | Гіпомагніємія, ниркова | AR | 21 | 62 |
CLDN19 | Гіпомагніємія, ниркова | AR | 7 | 20 |
CLPB | 3-метилглутаконова ацидурія з катарактою, ураженням нервової системи та нейтропенією (MEGCANN) | AR | 26 | 25 |
CYP24A1 | Гіперкальціємія, інфантильна 1 | AR | 8 | 40 |
FAM20A | Недосконалий амелогенез (емалево-нирковий синдром) | AR | 19 | 41 |
FOXI1 | Синдром Пендреда, збільшений вестибулярний водопровід | AR | 1 | 11 |
GNA11 | Гіпокальціємія, Гіпокальціурична гіперкальціємія | AD | 11 | 11 |
GPHN | Гіперекплексія, дефіцит кофактора молібдену | AD/AR | 35 | 20 |
GRHPR | Гіпероксалурія | AR | 60 | 40 |
HNF4A | Вроджений гіперінсулінізм, чутливий до діазоксиду, діабет зрілого віку у молодих, ренотубулярний синдром Фанконі 4 з діабетом зрілого віку у молодих | AD | 32 | 147 |
HOGA1 | Гіпероксалурія | AD/AR | 37 | 33 |
HPRT1 | Синдром Лєша-Ніхана, синдром Келлі-Сігміллера | XL | 72 | 427 |
KCNJ1 | Синдром Барттера, антенатальний | AR | 11 | 66 |
MAGED2 | Синдром Барттера 5 типу, минущий антенатальний | XL | 6 | 7 |
MOCOS | Ксантинурія II типу | AR | 3 | 5 |
MOCS1 | Дефіцит кофактора молібдену | AR | 7 | 35 |
MOCS2 | Дефіцит кофактора молібдену | AR | 10 | 16 |
OCRL | Синдром Лоу, хвороба Дента | XL | 47 | 264 |
PRPS1 | Надактивність фосфорибозилпірофосфатсинтетази I, синдром Артса, хвороба Шарко-Марі-Тута, Х-зчеплений рецесивний, 5, Глухота, Х-зчеплений 1 | XL | 27 | 32 |
SLC12A1 | Синдром Барттера, антенатальний | AR | 18 | 81 |
SLC22A12 | Гіпоурикемія, ниркова 1 | AR | 8 | 40 |
SLC26A1 | Нефролітіаз, оксалат кальцію | AR | 18 | 5 |
SLC2A9 | Гіпоурикемія, ниркова, 2 | AD/AR | 9 | 20 |
SLC34A1 | Нефролітіаз/остеопороз, гіпофосфатемія, ренотубулярний синдром Фанконі, гіперкальціємія, інфантильна 2 | AD/AR | 22 | 29 |
SLC34A3 | Гіпофосфатемічний рахіт з гіперкальціурією | AR | 22 | 38 |
SLC3A1 | Цістинурія | AR | 26 | 241 |
SLC4A1 | Сфероцитоз, овальцитоз, нирковий канальцевий ацидоз, дистальний, з гемолітичною анемією, кріогідроцитоз, акантоцитоз, смуга 3 Мемфісу | AD/AR/BG | 38 | 122 |
SLC7A9 | Цістинурія | AD/AR | 24 | 159 |
SLC9A3R1 | Нефролітіаз/остеопороз, гіпофосфатемія, 2 | AD | 7 | |
UMOD | Сімейна ювенільна гіперурикемічна нефропатія, Гломерулокістозна хвороба нирок з гіперурикемією та ізостенурією, Медулярна кістозна хвороба нирок 2 | AD | 33 | 108 |
VDR | Вітамін D-залежний рахіт | AD/AR | 17 | 66 |
XDH | Ксантинурія I типу | AR | 10 | 21 |
* Тип успадкування: аутосомно-домінантний (AD), аутосомно-рецесивний (AR), мітохондріальний (mi), Х-зчеплений (XL), Х-зчеплений домінантний (XLD) та Х-зчеплений рецесивний (XLR); ** ClinVar, HGMD - кількість варіантів гена, класифікованих як патогенні або ймовірно патогенні в базі даних ClinVar, HGMD.
В панель дозволяється додати додаткові гени (до 200), пов'язані з симптомами, та видалити будь-які гени (щоб залишилося не менше 2). Вартість панелі може змінюватися, а саме:
- мала панель 2-25 генів ,
- середня панель 26-125 генів ,
- велика панель понад 126 генів .
Якщо аналіз виявив варіанти, що є можливою причиною хвороби, можна перевірити наявність цих варіантів у батьків. Аналіз окремих мутацій по Сенгеру.
Якщо аналіз не виявив варіантів, які є можливою причиною хвороби, можна розширити тестування до повного екзома Розширення панелі до повного екзома. Крім того, можна отримати сирі дані і робити повторну оцінку кожні кілька років. Можливо, згодом науці стануть відомі нові генетичні чинники захворювання.
Натще не потрібно, рясно пити воду.
Проводиться забір венозної крові в пробірку з ЕДТА 4 мл.
Забір матеріалу у нас у центрі або можна передати нам пробірку ЕДТА, взяту у будь-якій лабораторії. Про можливість забору у дітей уточнювати додатково.
У наших пунктах забору крім Києва забор матеріалу коштує .
Необхідно надати висновок лікаря з клінічною картиною (опис симтомів, діагноз), заповнити в електронному вигляді анкету.
Аналіз не проводиться для здорових людей без симптомів, у цьому випадку рекомендуються скринінгові аналізи на носійство.
За результатами секвенування необхідно отримати консультацію лікаря-генетика.