Аналізи ДНК в Україні
Всі аналізи/Панелі (секвенування NGS)
В панель Панель вродженого амаврозу Лебера входить 65 генів, оцінка некодуючих варіантів, виявлення делецій та дуплікацій, а також мітохондріальний геном.
Ідеальна панель для пацієнтів із клінічною підозрою на вроджений амавроз Лебера або споріднене захворювання.
Вроджений амавроз Лебера — важка дистрофія сітківки, що призводить до сліпоти або тяжких порушень зору у віці до 1 року. Лебера клінічно характеризується погіршенням зорової функції, що часто супроводжується ністагмом, аномальними зіничними реакціями, світлобоязню, високою далекозорістю, помітним зниженням електроретинограми і кератоконусом. за аутосомно-рецесивним типом. Повідомлялося про рідкісні домінантні випадки. 000 до 1:33 000.
Ген | Асоційований фенотип | Спадкоємність.* | ClinVar** | HGMD** |
---|---|---|---|---|
AIPL1 | Пігментний ретиніт, колбочкова дистрофія, вроджений амавроз Лебера. | AR | 10 | 79 |
ALMS1 | синдром Альстрема | AR | 197 | 302 |
BBS4 | Синдром Барде-Бідля | AR | 25 | 53 |
CABP4 | Куряча сліпота вроджена стаціонарна | AR | 6 | 11 |
CEP290 | Синдром Барде-Бідля, вроджений амавроз Лебера, синдром Жубера, синдром Сеніора-Локена, синдром Меккеля | AR | 130 | 289 |
CNGA3 | Вроджений амавроз Лебера, ахроматопсія | AR | 32 | 149 |
CRB1 | Пігментний ретиніт, пігментна паравенозна хоріоретинальна атрофія, вроджений амавроз Лебера | AR | 54 | 334 |
CRX | Дистрофія колб, вроджений амавроз Лебера. | AD/AR | 30 | 106 |
CWC27 | Пігментний ретиніт з аномаліями скелета або без них (RPSKA) | AR | 5 | 7 |
DTHD1 | Вроджений амавроз Лебера з м'язовою дистрофією | AR | 1 | |
GUCY2D | Дистрофія колб, вроджений амавроз Лебера. | AD/AR | 34 | 235 |
IDH3A | Лебер вроджений амавроз | AR | 7 | |
IMPDH1 | Пігментний ретиніт, уроджений амавроз Лебера. | AD | 7 | 23 |
IQCB1 | Синдром Сеніора-Локена | AR | 24 | 41 |
KCNJ13 | Вітреоретинальна дегенерація «сніжинка», вроджений амавроз Лебера | AD/AR | 6 | 10 |
LCA5 | Лебер вроджений амавроз | AR | 10 | 49 |
LRAT | Пігментний ретиніт, ювенільний, вроджений амавроз Лебера, точковий білий ретиніт, дистрофія сітківки, важкий ранній початок | AR | 8 | 23 |
MERTK | Пігментний ретиніт | AR | 25 | 75 |
MT-ATP6 | Нейропатія, атаксія та пігментний ретиніт, спадкова нейропатія зорового нерва Лебера, атаксія та полінейропатія, початок у дорослих, кардіоміопатія, дитяча гіпертрофічна, синдром Лея, стріатонігральна дегенерація, дитяча, мітохондріальна | Mitochondrial | 19 | |
MT-ATP8 | Кардіоміопатія, апікальна гіпертрофія та нейропатія, Кардіоміопатія, інфантильна гіпертрофія | Mitochondrial | 4 | |
MT-CO1 | Міоглобінурія, рецидивна, спадкова нейропатія зорового нерва Лебера, сидеробластна анемія, дефіцит цитохром-С-оксидази, глухота, мітохондріальна | Mitochondrial | 17 | |
MT-CO2 | Дефіцит цитохрому с-оксидази | Mitochondrial | 8 | |
MT-CO3 | Дефіцит цитохром-с-оксидази, спадкова нейропатія зорового нерва Лебера | Mitochondrial | 9 | |
MT-CYB | Mitochondrial | 69 | ||
MT-ND1 | Мітохондріальна міопатія, енцефалопатія, лактоацидоз та інсультоподібні епізоди, спадкова оптична нейропатія Лебера, атрофія зорового нерва Лебера та дистонія | Mitochondrial | 21 | |
MT-ND2 | Спадкова оптична нейропатія Лебера, дефіцит мітохондріального комплексу I | Mitochondrial | 6 | |
MT-ND3 | Атрофія та дистонія зорового нерва Лебера, дефіцит мітохондріального комплексу I | Mitochondrial | 7 | |
MT-ND4 | Спадкова оптична нейропатія Лебера, атрофія та дистонія зорового нерва Лебера, дефіцит мітохондріального комплексу I | Mitochondrial | 11 | |
MT-ND4L | Спадкова оптична нейропатія Лебера | Mitochondrial | 2 | |
MT-ND5 | Міоклонічна епілепсія з рваними червоними волокнами, мітохондріальна міопатія, енцефалопатія, лактоацидоз та інсультоподібні епізоди, спадкова оптична нейропатія Лебера, дефіцит мітохондріального комплексу I | Mitochondrial | 19 | |
MT-ND6 | Мітохондріальна міопатія, енцефалопатія, лактоацидоз та інсультоподібні епізоди, онкоцитома, спадкова оптична нейропатія Лебера, атрофія та дистонія зорового нерва Лебера, дефіцит мітохондріального комплексу I | Mitochondrial | 16 | |
MT-RNR1 | Глухота, мітохондріальна | Mitochondrial | 3 | |
MT-RNR2 | Токсичність/резистентність до хлорамфеніколу | Mitochondrial | 2 | |
MT-TA | Mitochondrial | 4 | ||
MT-TC | Мітохондріальна міопатія, енцефалопатія, лактоацидоз та епізоди, подібні до інсульту. | Mitochondrial | 3 | |
MT-TD | Mitochondrial | 1 | ||
MT-TE | Синдром діабетичної глухоти, Мітохондріальна міопатія, інфантильна, транзиторна, Мітохондріальна міопатія при цукровому діабеті | Mitochondrial | 5 | |
MT-TF | Міоклонічна епілепсія з рваними червоними волокнами, Нефропатія, тубулоінтерстиціальна, Енцефалопатія, мітохондріальна, Епілепсія, мітохондріальна, Міопатія, мітохондріальна, Мітохондріальна енцефаломіопатія з ілактоацид | Mitochondrial | 7 | |
MT-TG | Mitochondrial | 3 | ||
MT-TH | Mitochondrial | 4 | ||
MT-TI | Mitochondrial | 7 | ||
MT-TK | Міоклонічна епілепсія з рваними червоними волокнами, синдром Лея | Mitochondrial | 5 | |
MT-TL1 | Дефіцит цитохром-с-оксидази, міоклонічна епілепсія з рваними червоними волокнами, мітохондріальна міопатія, енцефалопатія, лактоацидоз та інсультоподібні епізоди, синдром діабетичної глухоти, синдром циклічного блювання, СВДС, сприйняття | Mitochondrial | 14 | |
MT-TL2 | Мітохондріальне мультисистемне захворювання, прогресуюча зовнішня офтальмоплегія, мітохондріальна міопатія, мітохондріальна енцефаломіопатія з лактоацидозом та інсультоподібними епізодами. | Mitochondrial | 5 | |
MT-TM | синдром Лея, мітохондріальне мультисистемне захворювання | Mitochondrial | 1 | |
MT-TN | Прогресуюча зовнішня офтальмоплегія, мітохондріальне мультисистемне захворювання. | Mitochondrial | 3 | |
MT-TP | Mitochondrial | 2 | ||
MT-TQ | Мітохондріальне мультисистемне захворювання | Mitochondrial | 2 | |
MT-TR | Енцефалопатія, мітохондріальна | Mitochondrial | 2 | |
MT-TS1 | Міоклонічна епілепсія з рваними червоними волокнами, мітохондріальною міопатією, енцефалопатією, лактоацидозом та інсультоподібними епізодами. | Mitochondrial | 10 | |
MT-TS2 | Мітохондріальне мультисистемне захворювання | Mitochondrial | 2 | |
MT-TT | Mitochondrial | 5 | ||
MT-TV | Гіпертрофічна кардіоміопатія (ГКМП), синдром Лі, мітохондріальне мультисистемне захворювання, мітохондріальна енцефаломіопатія з лактоацидозом та інсультоподібними епізодами | Mitochondrial | 3 | |
MT-TW | синдром Лея, міопатія, мітохондріальна | Mitochondrial | 8 | |
MT-TY | Мітохондріальне мультисистемне захворювання | Mitochondrial | 4 | |
MYO7A | Глухота аутосомно-домінантний 11, Синдром Ушера I тип, Глухота аутосомно-рецесивний 2 | AD/AR | 239 | 515 |
NMNAT1 | Лебер вроджений амавроз | AR | 20 | 74 |
RD3 | Лебер вроджений амавроз | AR | 5 | 13 |
RDH12 | Пігментний ретиніт, уроджений амавроз Лебера. | AD/AR | 23 | 102 |
RDH5 | Білоточкове дно | AR | 11 | 51 |
RPE65 | Пігментний ретиніт, уроджений амавроз Лебера. | AD/AR | 31 | 197 |
RPGRIP1 | Дистрофія колб, вроджений амавроз Лебера. | AR | 44 | 145 |
SPATA7 | Лебер вроджений амавроз, пігментний ретитиніт | AR | 15 | 39 |
TUBB4B | Вроджений амавроз Лебера, втрата слуху | AD | 2 | 3 |
TULP1 | Пігментний ретиніт, уроджений амавроз Лебера. | AR | 24 | 74 |
* Тип успадкування: аутосомно-домінантний (AD), аутосомно-рецесивний (AR), мітохондріальний (mi), Х-зчеплений (XL), Х-зчеплений домінантний (XLD) та Х-зчеплений рецесивний (XLR); ** ClinVar, HGMD - кількість варіантів гена, класифікованих як патогенні або ймовірно патогенні в базі даних ClinVar, HGMD.
В панель дозволяється додати додаткові гени (до 200), пов'язані з симптомами, та видалити будь-які гени (щоб залишилося не менше 2). Вартість панелі може змінюватися, а саме:
- мала панель 2-25 генів ,
- середня панель 26-125 генів ,
- велика панель понад 126 генів .
Якщо аналіз виявив варіанти, що є можливою причиною хвороби, можна перевірити наявність цих варіантів у батьків. Аналіз окремих мутацій по Сенгеру.
Якщо аналіз не виявив варіантів, які є можливою причиною хвороби, можна розширити тестування до повного екзома Розширення панелі до повного екзома. Крім того, можна отримати сирі дані і робити повторну оцінку кожні кілька років. Можливо, згодом науці стануть відомі нові генетичні чинники захворювання.
Натще не потрібно, рясно пити воду.
Проводиться забір венозної крові в пробірку з ЕДТА 4 мл.
Забір матеріалу у нас у центрі або можна передати нам пробірку ЕДТА, взяту у будь-якій лабораторії. Про можливість забору у дітей уточнювати додатково.
У наших пунктах забору крім Києва забор матеріалу коштує .
Необхідно надати висновок лікаря з клінічною картиною (опис симтомів, діагноз), заповнити в електронному вигляді анкету.
Аналіз не проводиться для здорових людей без симптомів, у цьому випадку рекомендуються скринінгові аналізи на носійство.
За результатами секвенування необхідно отримати консультацію лікаря-генетика.