Аналізи ДНК в Україні
Всі аналізи/Панелі (секвенування NGS)
В панель Гемолітико-уремічний синдром входить 9 генів, також включена оцінка некодуючих варіантів, виявлення делецій та дуплікацій.
Ідеальна панель для пацієнтів з клінічною підозрою на гемолітико-уремічний синдром або споріднене захворювання.
Гемолітико-уремічний синдром (HUS) характеризується гемолітичною анемією, тромбоцитопенією та порушенням функції нирок. Пацієнти із сімейною формою аГУС мають поганий прогноз: частота термінальної стадії захворювання нирок або смерті становить від 50 до 80% (PMID: 19846853) У осіб з генетичним атиповим гемолітико-уремічним синдромом часто спостерігається рецидив навіть після повного одужання після даного епізоду. приблизно 30% випадків, CD46 - 12%, CFI - 5-10%, C3 - 5% і THBD.за 3%-5% При aHUS з раннім початком, що визначається як початок захворювання у віці до 1 року, мутації в DGKE пояснюють 27% випадків. aHUS успадковується за аутосомно-рецесивним або аутосомно-домінантним типом з неповною Пенетрантність.Лікування можна оптимізувати за допомогою генетичного тестування. Слід уникати трансплантації живої нирки від родинних осіб, оскільки вони також можуть піддаватися підвищеному генетичному ризику захворювання. у пацієнтів з CFH, CFI, C3, THBD або CFB мутацією; однак одночасна трансплантація нирки та печінки дітям раннього віку з aHUS та CFH мутацією може виправити генетичний дефект і запобігти рецидиву захворювання.
Ген CFH має кілька псевдогенних екзонів (екзони 8–9, 11, 21–23). CFHR1-4»).
Генетика атипового гемолітико-уремічного синдрому (aHUS) Мутації CFH становлять приблизно 30% випадків, CD46 (також відомий як MCP) - 12%, CFI - 5-10%, C3 - 5%, THBD - 3-5% При aHUS з раннім початком (захворювання проявляється у віці до 1 року) мутації в DGKE пояснюють 27% випадків. Тип спадкування важко визначити для більшості генів, пов'язаних з aHUS, з-за низької пенетрантності, але схильність до захворювання зазвичай є аутосомно-домінантною. не є патогенними чи ймовірно патогенними. сімей, де у пробандів є новий варіант гена aHUS, деякі зі здорових батьків або інших членів сім'ї є носіями того ж варіанта. PubMed: 9811382). було показано, що делеції генів від CFHR1 до CFHR5 дещо збільшують ризик аГУС. копія 35% проти 9% та дві копії 55% проти 89%), що вказує на відношення шансів. (OR) 6,3 для гомозиготної делеції і 3,8 для гетерозиготної. аГУС та 118 пацієнтів з контрольної групи. Гомозиготна делеція CFHR1 була виявлена у 32% протестованих пацієнтів з аГУС та у 2,5% контрольної групи. і у 6% пацієнтів без неї. з aHUS спостерігався значно нижчий рівень тромбоцитів на початку захворювання і значно менш часто ураження центральної нервової системи, ніж у антитіл-негативних пацієнтів. -Мабуть, краще корелює з титром імунних комплексів, ніж з титром FHAA (PubMed: 22922817) У 2016 році Чалліс та ін. описали новий гібридний ген CFH/CFHR3 у пацієнта з aHUS, вторинним по відношенню до делеції de novo розміром 6,3 т.п.н., яка виникла в результаті опосередкованого мікрогомологією з'єднання кінців, а не неалельної гомологічної рекомбінації. Секретований білковий продукт позбавлений домену впізнавання фактора H і демонструє порушену регуляцію комплементу на клітинній поверхні. Той факт, що утворення цього гібридного гена виникло як подія de novo, дозволяє припустити, що цей кластер являє собою динамічну область геному, в якій можуть виникати додаткові геномні порушення (PubMed: 26490391). /p>
25 серпня 2017 року Blueprint Genetics виключила гени CFHR1, CFHR2, CFHR3, CFHR4 з трьох діагностичних панелей NGS, включаючи панель первинного імунодефіциту, панель порушень системи комплементу та панель гемолітико-уремічного синдрому. генами, що утруднювало або навіть унеможливлювало надійне визначення числа копій цих генів за допомогою методів NGS з короткою довжиною зчитування. поширеності aHUS (9 на 1 000 000); 2) частоту гомозиготної делеції CFHR1 (2%) та 3) припущення, що всі випадки aHUS будуть викликані цим дефектом (переоцінка ефекту), у нас залишається той факт, що 99. 95% людей з гомозиготною делецією CFHR1 ніколи не захворіють aHUS. вважаємо, що вивільнення кількості копій генів CFHR1-4 може вводити в оману та не буде корисним у клінічній практиці. Ми вважаємо, що з'єднання генів між CFH і CFHR1-4 можуть бути механізмом, що пояснює зв'язок між делеціями гена CFHR1-4 та aHUS. >
Ген | Асоційований фенотип | Спадкоємність.* | ClinVar** | HGMD** |
---|---|---|---|---|
ADAMTS13 | Синдром Шульмана-Апшоу, тромботична тромбоцитопенічна пурпура, сімейний | AR | 30 | 183 |
C3 | Гемолітико-уремічний синдром, атиповий, дефіцит компонента комплементу 3, дегенерація жовтої плями, вікової | AD/AR | 6 | 87 |
CD46 | Гемолітико-уремічний синдром, атиповий | AD/AR | 5 | 81 |
CFB | Дефіцит фактора комплементу B, Гемолітико-уремічний синдром, атиповий | AD/AR | 2 | 26 |
CFH | Гемолітико-уремічний синдром, атиповий, дефіцит фактора комплементу H, базальні ламінарні друзи | AD/AR | 18 | 305 |
CFHR5 | Атиповий гемолітико-уремічний синдром з антитілами до фактору Н, гломерулонефрит С3. | AD/AR | 4 | 32 |
CFI | Гемолітико-уремічний синдром, атиповий, дефіцит фактора комплементу I | AD/AR | 10 | 143 |
DGKE | Нефротичний синдром | AR | 17 | 38 |
THBD | Тромбофілія внаслідок дефекту тромбомодуліну, Гемолітико-уремічний синдром, атиповий | AD | 5 | 28 |
* Тип успадкування: аутосомно-домінантний (AD), аутосомно-рецесивний (AR), мітохондріальний (mi), Х-зчеплений (XL), Х-зчеплений домінантний (XLD) та Х-зчеплений рецесивний (XLR); ** ClinVar, HGMD - кількість варіантів гена, класифікованих як патогенні або ймовірно патогенні в базі даних ClinVar, HGMD.
В панель дозволяється додати додаткові гени (до 200), пов'язані з симптомами, та видалити будь-які гени (щоб залишилося не менше 2). Вартість панелі може змінюватися, а саме:
- мала панель 2-25 генів ,
- середня панель 26-125 генів ,
- велика панель понад 126 генів .
Якщо аналіз виявив варіанти, що є можливою причиною хвороби, можна перевірити наявність цих варіантів у батьків. Аналіз окремих мутацій по Сенгеру.
Якщо аналіз не виявив варіантів, які є можливою причиною хвороби, можна розширити тестування до повного екзома Розширення панелі до повного екзома. Крім того, можна отримати сирі дані і робити повторну оцінку кожні кілька років. Можливо, згодом науці стануть відомі нові генетичні чинники захворювання.
Натще не потрібно, рясно пити воду.
Проводиться забір венозної крові в пробірку з ЕДТА 4 мл.
Забір матеріалу у нас у центрі або можна передати нам пробірку ЕДТА, взяту у будь-якій лабораторії. Про можливість забору у дітей уточнювати додатково.
У наших пунктах забору крім Києва забор матеріалу коштує .
Необхідно надати висновок лікаря з клінічною картиною (опис симтомів, діагноз), заповнити в електронному вигляді анкету.
Аналіз не проводиться для здорових людей без симптомів, у цьому випадку рекомендуються скринінгові аналізи на носійство.
За результатами секвенування необхідно отримати консультацію лікаря-генетика.