Аналізи ДНК в Україні
Всі аналізи/Панелі (секвенування NGS)
В панель "Хвороби накопичення глікогену" входить 29 генів, також включена оцінка некодуючих варіантів, виявлення делецій та дуплікацій.
Ідеально підходить для пацієнтів із клінічною підозрою на порушення накопичення глікогену або хворобу Лафори. Гени цієї панелі включені в комплексну панель метаболізму.
Деякі форми хвороби накопичення глікогену вражають лише один тип тканини, тоді як інші вражають декілька систем органів. Взагалі кажучи, хвороби накопичення глікогену можна розділити на ті, які пов'язані з ураженням печінки і проявляються в основному гіпоглікемією, і ті, що пов'язані з нервово-м'язовими захворюваннями та слабкістю. Тяжкість варіюється від смерті в дитинстві за відсутності лікування до легких порушень з нормальною тривалістю життя. Хвороба Лафори, одна з форм міоклонічної епілепсії, характеризується накопиченням тілець Лафори, що складаються з крохмалоподібних поліглюкозанів, які є недостатньо розгалуженими і, отже, нерозчинними молекулами глікогену. Таким чином, хвороба Лафора відноситься до хвороб накопичення глікогену і включена до цієї панелі. Ця панель дозволяє легко визначити генетичну основу хвороб накопичення глікогену у клінічних умовах. За оцінками, захворюваність на всі форми хвороб накопичення глікогену становить приблизно 1 випадок на 20 000-25 000 новонароджених. Ці розлади трапляються у всіх етнічних групах; різні типи хвороби накопичення глікогену більш поширені у певних популяціях через мутації-засновники. Більшість хвороб накопичення глікогену успадковуються за аутосомно-рецесивним типом. Однак дві форми успадковуються рецесивним чином, зчепленим із Х-хромосомою.
Ген | Асоційований фенотип | Спадкоємність.* | ClinVar** | HGMD** |
---|---|---|---|---|
AGL | Хвороба накопичення глікогену | AR | 142 | 245 |
ALDOA | Хвороба накопичення глікогену | AR | 3 | 8 |
ENO3 | Хвороба накопичення глікогену | AR | 3 | 6 |
EPM2A | Епілепсія, прогресуюча міоклонія | AR | 17 | 77 |
FBP1 | Дефіцит фруктозо-1,6-бісфосфатази | AR | 25 | 44 |
G6PC | Хвороба накопичення глікогену | AR | 46 | 117 |
GAA | Хвороба накопичення глікогену (хвороба Помпе) | AR | 193 | 573 |
GBE1 | Хвороба накопичення глікогену | AR | 36 | 70 |
GYG1 | Хвороба накопичення глікогену, міопатія поліглюкозанових тіл 2 | AR | 9 | 16 |
GYS1 | Хвороба накопичення глікогену | AR | 8 | 5 |
GYS2 | Хвороба накопичення глікогену | AR | 20 | 23 |
LAMP2 | Данон хвороба | XL | 62 | 101 |
LDHA | Хвороба накопичення глікогену | AR | 1 | 9 |
NHLRC1 | Епілепсія, прогресуюча міоклонія | AR | 14 | 70 |
PFKM | Хвороба накопичення глікогену | AR | 12 | 26 |
PGAM2 | Хвороба накопичення глікогену | AR | 4 | 11 |
PGK1 | Дефіцит фосфогліцераткінази 1 | XL | 16 | 26 |
PGM1 | Вроджене порушення глікозилювання | AR | 11 | 35 |
PHKA1 | Хвороба накопичення глікогену | XL | 9 | 8 |
PHKA2 | Хвороба накопичення глікогену | XL | 36 | 114 |
PHKB | Хвороба накопичення глікогену | AR | 9 | 26 |
PHKG2 | Хвороба накопичення глікогену | AR | 12 | 33 |
PRKAG2 | Гіпертрофічна кардіоміопатія (ГКМП), синдром Вольфа-Паркінсона-Уайта, хвороба накопичення глікогену в серці, вроджений летальний кінець | AD | 19 | 57 |
PRKAG3 | Підвищений вміст гліогену в скелетних м'язах | AD | 1 | 1 |
PYGL | Хвороба накопичення глікогену | AR | 21 | 44 |
PYGM | Хвороба накопичення глікогену | AR | 77 | 168 |
RBCK1 | Поліглюкозанова міопатія тіла | AR | 11 | 14 |
SLC2A2 | Хвороба накопичення глікогену, синдром Фанконі-Біккеля, неонатальний цукровий діабет | AR | 24 | 73 |
SLC37A4 | Хвороба накопичення глікогену | AD/AR | 49 | 113 |
* Тип успадкування: аутосомно-домінантний (AD), аутосомно-рецесивний (AR), мітохондріальний (mi), Х-зчеплений (XL), Х-зчеплений домінантний (XLD) та Х-зчеплений рецесивний (XLR); ** ClinVar, HGMD - кількість варіантів гена, класифікованих як патогенні або ймовірно патогенні в базі даних ClinVar, HGMD.
В панель дозволяється додати додаткові гени (до 200), пов'язані з симптомами, та видалити будь-які гени (щоб залишилося не менше 2). Вартість панелі може змінюватися, а саме:
- мала панель 2-25 генів ,
- середня панель 26-125 генів ,
- велика панель понад 126 генів .
Якщо аналіз виявив варіанти, що є можливою причиною хвороби, можна перевірити наявність цих варіантів у батьків. Аналіз окремих мутацій по Сенгеру.
Якщо аналіз не виявив варіантів, які є можливою причиною хвороби, можна розширити тестування до повного екзома Розширення панелі до повного екзома. Крім того, можна отримати сирі дані і робити повторну оцінку кожні кілька років. Можливо, згодом науці стануть відомі нові генетичні чинники захворювання.
Натще не потрібно, рясно пити воду.
Проводиться забір венозної крові в пробірку з ЕДТА 4 мл.
Забір матеріалу у нас у центрі або можна передати нам пробірку ЕДТА, взяту у будь-якій лабораторії. Про можливість забору у дітей уточнювати додатково.
У наших пунктах забору крім Києва забор матеріалу коштує .
Необхідно надати висновок лікаря з клінічною картиною (опис симтомів, діагноз), заповнити в електронному вигляді анкету.
Аналіз не проводиться для здорових людей без симптомів, у цьому випадку рекомендуються скринінгові аналізи на носійство.
За результатами секвенування необхідно отримати консультацію лікаря-генетика.