Аналізи ДНК в Україні
Всі аналізи/Панелі (секвенування NGS)
В панель Ектодермальна дисплазія входить 25 генів, також включена оцінка некодуючих варіантів.
Ідеальна панель для пацієнтів з клінічною підозрою на ектодермальну дисплазію (гідротичну або гіпогідротичну) або синдром Елліса-ван Кревельда.
Ектодермальна дисплазія (ED) є групою тісно пов'язаних станів, з яких ідентифіковано понад 150 різних синдромів. ED впливає на розвиток або функцію зубів, волосся, нігтів та потових залоз. ED може виявлятися ізольовано або як частина синдромального захворювання і зазвичай поділяється на підтипи в залежності від здатності потовиділення. Клінічні особливості Х-зчепленої та аутосомної форм гіпогідротичної ектодермальної дисплазії (HED) можуть бути невиразними, і багато залучених генів можуть призводити до фенотипно різних результатів залежно від кількості дефектних алелів. Найбільш поширеними ED є гіпогідротична ED та гідротична ED. Х-зчеплена гіпогідротична ектодермальна дисплазія (HED) викликана мутаціями EDA і пояснює 75–95% сімейної HED та 50% спорадичних випадків. HED характеризується трьома основними ознаками: гіпотрихозом (рідкісне, повільно росте волосся і рідкі/відсутні брови), зниженим потовиділенням та гіподонтією (відсутність або дрібні зуби). Зниження потовиділення створює ризик епізодів гіпертермії. Жінки-носії можуть мати певний ступінь гіподонтії та легкий гіпотрихоз. Описано також ізольовані зубні фенотипи. Мутації в WNT10A зареєстровані у 9% людей з HED та у 25% людей з HED, у яких немає дефектів EDA. Приблизно у 50% людей з гетерозиготною мутацією WNT10A є HED, і найбільш стійкою клінічною ознакою є важка олігодентія постійних зубів. Мутації EDAR пояснюють 7% HED та пов'язані як з аутосомно-домінантною, так і з рецесивною ЕД. Ця панель забезпечує диференціальну діагностику, оскільки охоплює багато синдромів, які можуть виявлятися при ЕД. Декілька синдромів, що характеризуються ED та втратою слуху, пов'язані з мутаціями GJB2, включаючи синдром KID, синдром Вохвінкеля, синдром Барта-Памфрі. Гідротична ED 2-го типу зумовлена аутосомно-домінантними мутаціями GJB6 і характеризується гіпотрихозом, дисплазією нігтів та долонно-підошовним гіперкератозом. На відміну від інших ектодермальних дисплазій, потовиділення та розвиток зубів є нормальними. Рецесивні мутації EVC і EVC2 викликають синдром Елліса-ван Кревельда, що характеризується ED, карликовістю, полідактилією та вадами серця, проте домінантні мутації в тих же генах викликають менш тяжкий акрофаціальний дизостоз Вейєрса. Виразність ED, пов'язаної з DSP, варіюється, включаючи кучерявість волосся, алопецію, гіперкератотичні бляшки, затримку розвитку, дилатаційну та аритмогенну кардіоміопатію правого шлуночка. Найбільш важким проявом є летальний акантолітичний бульозний епідермоліз. Поширеність HED оцінюється в 1:5 000-10 000 новонароджених, тоді як поширеність синдрому Елліса-ван Кревельда становить 1:60 000-200 000.
Ген | Асоційований фенотип | Спадкоємність.* | ClinVar** | HGMD** |
---|---|---|---|---|
BCS1L | Синдром Бйорнстада, синдром GRACILE, синдром Лі, дефіцит мітохондріального комплексу III, ядерний тип 1 | AR | 42 | 37 |
CDH3 | Гіпотрихоз уроджений з ювенільною макулярною дистрофією, ектодермальною дисплазією, ектродактилією та синдромом макулярної дистрофії | AR | 7 | 30 |
DSP | Кардіоміопатія розширена з ворсистим волоссям, кератодермією та агенезією зубів, Аритмогенна дисплазія правого шлуночка, сімейна, Кардіоміопатія розширена, з ворсистим волоссям та кератодермією, Долонно-підошовний смугастий кератоз II, акантолітичний | AD/AR | 177 | 296 |
EDA | Ектодермальна дисплазія, гіпогідротична, агенезія зубів, селективна | XL | 115 | 326 |
EDAR | Ектодермальна дисплазія, ангідротична, Морфологія волосся | AD/AR | 38 | 61 |
EDARADD | Ектодермальна дисплазія, ангідротична, аутосомно-рецесивна, Ектодермальна дисплазіязія, ангідротична, аутосомно-домінантна, Ектодермальна дисплазія, гіпогідротична, аутосомно-домінантна, Ектодермальна дисплазія, гіпогідротична, аутосомно-рецесивна | AD/AR | 8 | 10 |
ERCC2 | Пігментна ксеродерма, Трихотіодистрофія, фотосенсибілізація, Цереброкулофаціоскелетний синдром 2 | AR | 26 | 98 |
EVC | Акрофаціальний дизостоз Вейєрса, синдром Елліса-Ван Кревельда | AD/AR | 58 | 83 |
EVC2 | Синдром Елліса-Ван Кревельда, акродентальний дизостоз Вейєрса | AD/AR | 78 | 75 |
GJB2 | Синдром Барта-Памфрі, Кератодермія долонно-підошовна з глухотою, Синдром Вохвінкеля, Гістрікс-подібний іхтіоз з глухотою, Синдром кератит-іхтіоз-глухота, Глухота аутосомно-рецесивний 1А | AD/AR/Digenic | 133 | 405 |
GJB6 | Глухота, аутосомно-домінантний тип 3В, Ектодермальна дисплазія, гідротична (синдром Клоустона), Глухота, аутосомно-рецесивний тип 1В. | AD/AR | 10 | 33 |
HOXC13 | Ектодермальна дисплазія 9 | AR | 3 | 10 |
HR | Гіпотрихоз 4, Атрихія з папульозними ураженнями, Уроджена універсальна алопеція. | AD/AR | 15 | 52 |
IFT122 | Синдром Сенсенбреннера, краніоектодермальна дисплазія (Левіна-Сенсенбреннера) 1 типу, краніоектодермальна дисплазія (Левіна-Сенсенбреннера) 2 типу | AR | 13 | 23 |
JUP | Аритмогенна дисплазія правого шлуночка, хвороба Наксоса | AD/AR | 8 | 46 |
LRP6 | Агенезія зубів, вибіркова, 7 | AD | 19 | 37 |
MPLKIP | Трихотіодистрофія 4, нефоточутлива | AR | 8 | 19 |
PAX9 | Агенезія зубів, вибіркова, 3 | AD | 19 | 57 |
PORCN | Вогнища дермальна гіпоплазія | XL | 16 | 121 |
PRKD1 | Вроджені вади серця та ектодермальна дисплазія. | AD | 2 | 7 |
PVRL4 | Синдром ектодермальної дисплазії-синдактилії 1 | AR | 6 | 10 |
RMRP | Хрящово-волосяна гіпоплазія, Метафізарна дисплазія без гіпотрихозу, Анауксетична дисплазія | AR | 87 | 123 |
TP63 | Синдром Раппа-Ходжкіна, орофаціальна ущелина, синдром Дорослих, ектродактилія, ектодермальна дисплазія та синдром ущелини губи/піднебіння, анкілоблефарон-ектодермальні дефекти – ущелина губи/піднебіння, пороки розвитку разд> | AD | 59 | 122 |
WDR35 | Краніоектодермальна дисплазія (Левіна-Сенсенбреннера) 1 тип, Краніоектодермальна дисплазія (Левіна-Сенсенбреннера) 2 типу, Синдром коротких ребер-полідактилії 5 типу | AR | 28 | 31 |
WNT10A | Одонтооніходермальна дисплазія, агенезія зубів, селективна, синдром Шопфа-Шульца-Пассарге | AD/AR | 23 | 81 |
* Тип успадкування: аутосомно-домінантний (AD), аутосомно-рецесивний (AR), мітохондріальний (mi), Х-зчеплений (XL), Х-зчеплений домінантний (XLD) та Х-зчеплений рецесивний (XLR); ** ClinVar, HGMD - кількість варіантів гена, класифікованих як патогенні або ймовірно патогенні в базі даних ClinVar, HGMD.
В панель дозволяється додати додаткові гени (до 200), пов'язані з симптомами, та видалити будь-які гени (щоб залишилося не менше 2). Вартість панелі може змінюватися, а саме:
- мала панель 2-25 генів ,
- середня панель 26-125 генів ,
- велика панель понад 126 генів .
Якщо аналіз виявив варіанти, що є можливою причиною хвороби, можна перевірити наявність цих варіантів у батьків. Аналіз окремих мутацій по Сенгеру.
Якщо аналіз не виявив варіантів, які є можливою причиною хвороби, можна розширити тестування до повного екзома Розширення панелі до повного екзома. Крім того, можна отримати сирі дані і робити повторну оцінку кожні кілька років. Можливо, згодом науці стануть відомі нові генетичні чинники захворювання.
Натще не потрібно, рясно пити воду.
Проводиться забір венозної крові в пробірку з ЕДТА 4 мл.
Забір матеріалу у нас у центрі або можна передати нам пробірку ЕДТА, взяту у будь-якій лабораторії. Про можливість забору у дітей уточнювати додатково.
У наших пунктах забору крім Києва забор матеріалу коштує .
Необхідно надати висновок лікаря з клінічною картиною (опис симтомів, діагноз), заповнити в електронному вигляді анкету.
Аналіз не проводиться для здорових людей без симптомів, у цьому випадку рекомендуються скринінгові аналізи на носійство.
За результатами секвенування необхідно отримати консультацію лікаря-генетика.