Аналізи ДНК в Україні
Всі аналізи/Панелі (секвенування NGS)
Представлена панель із 67 генів, яка включає оцінку некодуючих варіантів. Крім того, він також включає спадковий по материнській лінії мітохондріальний геном.
Ідеально підходить для пацієнтів з клінічним підтвердженням моногенного або неонатального сахарного діабету.
Моногенний діабет складається з гетерогенної групи типів діабету, викликаних мутаціями в окремих генах, які, за оцінкою, складають 1-2% усіх випадків сахарного діабету. Основні фенотипи, що вказують на основну моногенну причину, включають сахарний діабет новонароджених, діабет молодих у зрілому віці (MODY) та інші дуже редкі синдроми, пов'язані з діабетом.
Перманентний неонатальний сахарний діабет — моногенна форма неонатального діабету, що характеризується персистуючою гіперглікемією протягом перших 12 місяців життя в цілому (середній вік дебюту — дев'ять неділь), що потребує постійного лікування інсуліном. Начальні клінічні прояви включають гіперглікемію, глюкозурію, затримку внутрішньоутробного розвитку, осмотічну поліурію, важке знеболювання та відсутність набору маси тіла. Попередня форма неонатального сахарного діабету зазвичай проходить до 18-місячного віку. Багато пацієнтів знаходять якусь ступінь порушення координації розвитку. Частота неонатального сахарного діабету оцінюється 1:100 000 живорождений. Близько 50% випадків є постійними та 50% попередніми. Такий стан було зареєстровано у всіх етнічних групах і в рівній мірі поражає молодь чоловічого та жіночого пола. Неонатальний діабет частіше всього викликає мутації в генах KCNJ11 (34%), ABCC8 (24%), INS (13%) і GCK (4%). Клінічні прояви відрізняються в залежності від основного генетичного дефекту. У випадках, пов’язаних з KCNJ11 і ABCC8, пацієнти зазвичай звертаються у віці до трьох місяців із симптоматичною гіперглікемією та часто з кетоацидозом. Приблизно 25% пацієнтів з мутаціями в гені KCNJ11 пов'язані з неврологічними симптомами, включаючи затримку розвитку та епілепсії (DEND-синдром) або більш легку форму без судорог і з менш вираженою затримкою розвитку. У випадках з мутацією в гені INS у пацієнтів відзначається виражена гіперглікемія або діабетичний кетоацидоз в середньому через дев'ять неділь, а у деяких - у більш позньому віці. Пацієнти з мутацією в GCK мають постійний інсулінозалежний діабет з першого дня життя.
Діабет молодих (MODY) є аутосомно-домінантною спадковою формою діабету і складає 1-2% людей з діабетом. MODY — редка клінічно і генетично гетерогенна форма діабету, що характеризується молодим віком дебюту (чаще 10–45 років) з розвитком інсуліннезалежного діабету до 25 років. Крім того, також були відзначені аномалії кровоносних судин сетчатки (ретинопатії) і почек, а також вроджені аномалії із-за ускладнень діабету. Лица з MODY зазвичай не мають історії ожиріння або метаболічного синдрому, що супроводжує гіперглікемію. Багато людей з MODY неправильно діагностують діабет 1 або 2 типу. MODY є найбільш поширеною формою моногенного діабету з поширеністю 1:10 000 у дорослих і 1:23 000 у дітей. Приблизно в 80% випадків помилково діагностується діабет 1 або 2 типу, що ускладнює оцінку поширеності та хворобливості. Генетичне тестування зазвичай проводиться тільки у пацієнтів з класичними визнаннями MODY. Однак тільки 50% пацієнтів з генетично діагностованим MODY відповідають класичним критеріям. Встановлення діагнозу MODY істотно впливає на клінічне ведення. Гетерозиготні мутації в HNF1A, HNF4A і GCK складають понад 90% усіх MODY з відомою генетичною причиною. Пацієнти з мутаціями HNF1A і HNF4A мають повільно прогресуючу дисфункцію бета-клеток, а лікування низькими дозами сульфонілсечовини призводить до стабільного або поліпшеного глікемічного контролю та поліпшення якості життя, пов'язаного з лікуванням діабету, порівняно з терапією інсуліном або метформіном. MODY з мутаціями GCK має унікальний фенотип легкої непрогресуючої гіперглікемії з показником глікованого гемоглобіну зазвичай <7% (53 ммоль/моль). Це не пов'язано з підвищеним ризиком мікро- і макрососудистих ускладнень, що спостерігаються при інших формах діабету. Як правило, лікування не змінює рівень глікованого гемоглобіну. Молекулярна діагностика MODY дозволяє припинити фармакологічну терапію та знизити частоту медичного спостереження.
Ген | Асоційований фенотип | Наслід.* | ClinVar** | HGMD** |
---|---|---|---|---|
ABCC8 | Гіперінсулінемічна гіпоглікемія, діабет, постійний неонатальний, гіпоглікемія, індукована лейцином, сахарний діабет, транзиторний неонатальний, легічна артеріальна гіпертензія (ЛАГ) | AD/AR | 170 | 641 |
APPL1 | Діабет зрелого віку у молодих, тип 14 | AD | 2 | 2 |
BLK | Діабет зрелого віку у молодих | AD | 5 | 9 |
CEL | Діабет зрелого віку у молодих, тип 8 | AD | 4 | 13 |
EIF2AK3 | СЕД, типу Уолкотта-Раллісона | AR | 9 | 80 |
FOXP3 | Імунодисрегуляція, поліендокринопатія та ентеропатія | XL | 28 | 93 |
GATA6 | Пороки серця, вроджені та інші вроджені аномалії, дефект міжпередсердної перегородки 9, дефект міжпередсердної перегородки 5, персистуючий артеріальний ствол, тетрада Фалло | AD | 16 | 82 |
GCK | Гіперінсулінемічна гіпоглікемія, сімейна, сахарний діабет, перманентний неонатальний, сахарний діабет зрелого віку у молодих, тип 2 | AD/AR | 178 | 837 |
GLIS3 | Сахарний діабет новонароджених з вродженим гіпотиреозом | AR | 7 | 18 |
GLUD1 | Гіперамоніємія-гіперінсулінізм, Гіперінсулінемічна гіпоглікемія | AD/AR | 14 | 38 |
HADH | Дефіцит 3-гідроксіацил-КоА-дегідрогенази | AR | 10 | 26 |
HNF1A | Сахарний діабет молодих з початком у зрілому віці, яєчно-клітинна карцинома, непапілярні світлоклітинні клітини, аденоматоз печі | AD | 78 | 528 |
HNF1B | Почечно-клітинний рак, непапілярний хромофоб, почечние кісти та діабетичний синдром | AD | 35 | 234 |
HNF4A | Вроджений гіперінсулінізм, чутливість до діазоксиду, діабет зрілого віку у молодих, ренотубулярний синдром Фанконі 4 з діабетом зрілого віку у молодих | AD | 32 | 147 |
INS | Сахарний діабет, постійний неонатальний, Гіперпроінсулінемія, сімейний, з діабетом або без нього, Діабет зрілого віку у молодих | AD/AR | 33 | 78 |
INSR | Гіперінсулінемічна гіпоглікемія, сімейна, синдром Рабсона-Менденхолла, синдром Донох'ю | AD/AR | 44 | 190 |
KCNJ11 | Гіперінсулінемічна гіпоглікемія, Діабет, постійний неонатальний, Сахарний діабет, транзиторний неонатальний, Діабет у віці молодих 13 років, Унаслідовані від отця мутації можуть викликати очагову аденоматозну гіперплазію | AD/AR | 63 | 178 |
KLF11 | Діабет зрелого віку у молодих | AD | 1 | 4 |
MT-ATP6 | Нейропатія, атаксія та пігментний ретиніт, спадкова оптична невропатія Лебера, атаксія та полінейропатія, з початком у дорослому віці, кардіоміопатія, інфантильна гіпертрофічна, синдром Лі, стриатоніграційна дегенерація, інфантильна, мітохондріальна | Мітохондріальний | 19 | |
MT-ATP8 | Кардіоміопатія, апікальна гіпертрофічна і нейропатія, Кардіоміопатія, інфантильна гіпертрофічна | Мітохондріальний | 4 | |
MT-CO1 | Міоглобінурія, рецидивуюча, спадкова оптична нейропатія Лебера, сидеробластна анемія, дефіцит цитохром-С-оксидази, глухота, мітохондріальна | Мітохондріальний | 17 | |
MT-CO2 | Дефіцит цитохрому з оксидази | Мітохондріальний | 8 | |
MT-CO3 | Дефіцит цитохрому з оксидази, спадкова оптична нейропатія Лебера | Мітохондріальний | 9 | |
MT-CYB | Мітохондріальний | 69 | ||
MT-ND1 | Мітохондріальна міопатія, енцефалопатія, лактоацидоз та інсультоподібні епізоди, спадкова оптична нейропатія Лебера, атрофія та дистонія зрительного нерва Лебера | Мітохондріальний | 21 | |
MT-ND2 | Наслідкова оптична нейропатія Лебера, дефіцит мітохондріального комплексу I | Мітохондріальний | 6 | |
MT-ND3 | Атрофія та дистонія зрительного нерва Лебера, дефіцит мітохондріального комплексу I | Мітохондріальний | 7 | |
MT-ND4 | Наслідкова оптична нейропатія Лебера, атрофія та дистонія зрительного нерва Лебера, дефіцит мітохондріального комплексу I | Мітохондріальний | 11 | |
MT-ND4L | Наслідна оптична нейропатія Лебера | Мітохондріальний | 2 | |
MT-ND5 | Міоклонічна епілепсія з червоними волокнами, мітохондріальна міопатія, енцефалопатія, лактоацидоз та інсультоподібні епізоди, спадкова оптична нейропатія Лебера, дефіцит мітохондріального комплексу I | Мітохондріальний | 19 | |
MT-ND6 | Мітохондріальна міопатія, енцефалопатія, лактоацидоз та інсультоподібні епізоди, онкоцитома, спадкова оптична нейропатія Лебера, атрофія та дистонія зрительного нерва Лебера, дефіцит мітохондріального комплексу I | Мітохондріальний | 16 | |
MT-RNR1 | Глухота, мітохондріальна | Мітохондріальний | 3 | |
MT-RNR2 | Токсичність/резистентність до хлорамфеніколу | Мітохондріальний | 2 | |
MT-TA | Мітохондріальний | 4 | ||
MT-TC | Мітохондріальна міопатія, енцефалопатія, лактоацидоз та інсультоподібні епізоди | Мітохондріальний | 3 | |
MT-TD | Мітохондріальний | 1 | ||
МТ-ТЕ | Діабет-синдром глухоти, мітохондріальна міопатія, інфантильна, транзиторна, мітохондріальна міопатія при сахарному діабеті | Мітохондріальний | 5 | |
MT-TF | Міоклонічна епілепсія з рваними червоними волокнами, нефропатія, тубулоінтерстиціальна, енцефалопатія, мітохондріальна, епілепсія, мітохондріальна, міопатія, мітохондріальна, мітохондріальна енцефаломіопатія з лактоацидозом та інсультоподібними епізодами | Мітохондріальний | 7 | |
MT-TG | Мітохондріальний | 3 | ||
MT-TH | Мітохондріальний | 4 | ||
MT-TI | Мітохондріальний | 7 | ||
МТ-ТЗ | Міоклонічна епілепсія з рваними червоними волокнами, синдром Лея | Мітохондріальний | 5 | |
MT-TL1 | Дефіцит цитохром-с-оксидази, міоклонічна епілепсія з рваними червоними волокнами, мітохондріальна міопатія, енцефалопатія, лактоацидоз та інсультоподібні епізоди, діабет-синдром глухоти, синдром циклічного ураження, СВДС, сприйнятливість к | Мітохондріальний | 14 | |
MT-TL2 | Мітохондріальне мультисистемне захворювання, прогресуюча зовнішня офтальмоплегія, мітохондріальна міопатія, мітохондріальна енцефаломіопатія з лактоацидозом та інсультоподібними епізодами | Мітохондріальний | 5 | |
МТ-ТМ | Синдром Лея, мітохондріальне мультисистемне розстройство | Мітохондріальний | 1 | |
MT-TN | Прогресуюча зовнішня офтальмоплегія, мітохондріальне мультисистемне захворювання | Мітохондріальний | 3 | |
МТ-ТП | Мітохондріальний | 2 | ||
MT-TQ | Мітохондриальное мультисистемное расстройство | Мітохондріальний | 2 | |
MT-TR | Енцефалопатія, мітохондріальна | Мітохондріальний | 2 | |
MT-TS1 | Міоклонічна епілепсія з червоними волокнами, мітохондріальна міопатія, енцефалопатія, лактоацидоз та інсультоподібні епізоди | Мітохондріальний | 10 | |
MT-TS2 | Мітохондриальное мультисистемное расстройство | Мітохондріальний | 2 | |
MT-TT | Мітохондріальний | 5 | ||
МТ-ТВ | Гіпертрофічна кардіоміопатія (ГКМП), синдром Лі, мітохондріальне мультисистемне захворювання, мітохондріальна енцефаломіопатія з лактоацидозом та інсультоподібними епізодами | Мітохондріальний | 3 | |
MT-TW | Синдром Лі, міопатія, мітохондріальна | Мітохондріальний | 8 | |
MT-TY | Мітохондриальное мультисистемное расстройство | Мітохондріальний | 4 | |
NEUROD1 | Діабет зрелого віку у молодих | AD/AR | 3 | 18 |
НЕЙРОГ3 | Діарея, мальабсорбція, вроджена | AR | 3 | 8 |
PAX4 | Сахарний діабет | AD | 3 | 10 |
PDX1 | Агенезія піджелудкової залози, неонатальний сахарний діабет, діабет зрелого віку у молодих, тип 4, молочнокисла ацидемія із-за дефіциту PDX1 | AD/AR | 10 | 28 |
PPARG | Інсулінорезистентність, ліподистрофія, сімейна, часткова | AD/дигенний (важка дигенна резистентність до інсуліну може бути спричинена дигенними мутаціями в PPP1R3A та PPARG) | 19 | 49 |
PTF1A | Агенезия поджелудочной железы и мозжечка, Агенезия поджелудочной железы 2 | AR | 4 | 16 |
RFX6 | Гіпоплазія підшлункової залози, атрезія кишківника та аплазія або гіпоплазія жовчного міхура з трахеопищеводним свищом або без нього, синдром Мартинеса-Фріаса, синдром Мітчелла-Райлі | AR | 10 | 31 |
SLC16A1 | Гіперінсулінемічна гіпоглікемія, сімейна, дефект транспортера лактату в еритроцитах, дефіцит транспортера монокарбоксилату 1, міоклоніко-атонічна епілепсія | AD/AR | 12 | 14 |
SLC2A2 | Болезньний синдром накопичення глікогену, Фанконі-Біккеля, неонатальний сахарний діабет | AR | 24 | 73 |
UCP2 | Гіперінсулінізм | AD/AR | 7 | |
WFS1 | Синдром Вольфрама, Вольфрамоподобный синдром, аутосомно-домінантний, Глухота, аутосомно-домінантний 14.06.38, Катаракта 41 | AD/AR | 69 | 362 |
ZFP57 | Сахарний діабет, транзиторний неонатальний, 1 | AD | 7 | 15 |
* Тип успадкування: аутосомно-домінантний (AD), аутосомно-рецесивний (AR), мітохондріальний (mi), Х-зчеплений (XL), Х-зчеплений домінантний (XLD) та Х-зчеплений рецесивний (XLR); ** ClinVar, HGMD - кількість варіантів гена, класифікованих як патогенні або ймовірно патогенні в базі даних ClinVar, HGMD.
В панель дозволяється додати додаткові гени (до 200), пов'язані з симптомами, та видалити будь-які гени (щоб залишилося не менше 2). Вартість панелі може змінюватися, а саме:
- мала панель 2-25 генів ,
- середня панель 26-125 генів ,
- велика панель понад 126 генів .
Якщо аналіз виявив варіанти, що є можливою причиною хвороби, можна перевірити наявність цих варіантів у батьків. Аналіз окремих мутацій по Сенгеру.
Якщо аналіз не виявив варіантів, які є можливою причиною хвороби, можна розширити тестування до повного екзома Розширення панелі до повного екзома. Крім того, можна отримати сирі дані і робити повторну оцінку кожні кілька років. Можливо, згодом науці стануть відомі нові генетичні чинники захворювання.
Натще не потрібно, рясно пити воду.
Проводиться забір венозної крові в пробірку з ЕДТА 4 мл.
Забір матеріалу у нас у центрі або можна передати нам пробірку ЕДТА, взяту у будь-якій лабораторії. Про можливість забору у дітей уточнювати додатково.
У наших пунктах забору крім Києва забор матеріалу коштує .
Необхідно надати висновок лікаря з клінічною картиною (опис симтомів, діагноз), заповнити в електронному вигляді анкету.
Аналіз не проводиться для здорових людей без симптомів, у цьому випадку рекомендуються скринінгові аналізи на носійство.
За результатами секвенування необхідно отримати консультацію лікаря-генетика.