Аналізи ДНК в Україні
Всі аналізи/Панелі (секвенування NGS)
В панель Вроджена діарея входить 29 генів, також включена оцінка некодуючих варіантів, виявлення делецій та дуплікацій.
Ідеально підходить для пацієнтів з клінічними підозрами на хронічну діарею з раннім початком, вроджену пучкову ентеропатію/дисплазію кишкового епітелію або захворювання із включенням мікроворсинок.
Постійна діарея та затримка розвитку можуть бути викликані спадковими діареями. Вроджені діареї є групою рідкісних аутосомно-рецесивних ентеропатій з часто важким результатом. Вони можуть проявлятися пренатально із затримкою внутрішньоутробного розвитку, але початок захворювання зазвичай відбувається невдовзі після пологів і в окремих випадках у строк до 3-4 місяців. Діарея зазвичай буває часто, і в залежності від підтипу діареї стілець може містити високі рівні натрію або хлориду, що призводить до зневоднення та дисбалансу електролітів. У уражених немовлят часто спостерігається затримка розвитку, затримка розвитку, проблеми з печінкою та нирками та остеопороз. Генетичні дефекти були описані нещодавно, тому клінічна корисність мультигенних NGS-панелей при цій групі захворювань залишається невідомою.
Туфтінгова ентеропатія або кишкова епітеліальна дисплазія викликаються рецесивними мутаціями EPCAM і є найчастішим захворюванням у цій категорії з передбачуваною поширеністю 1:50 000-100 000. Він викликає «невиліковні» діареї, що починаються в ранньому дитинстві залежно від парентерального харчування та, зрештою, до необхідності трансплантації для лікування. Вроджена діарея типу 6 є єдиним аутосомно-домінантним захворюванням, на яке спрямована ця панель. Поширеність вроджених проносів найбільш висока в регіонах із великою кількістю кровноспоріднених шлюбів.
Ген | Асоційований фенотип | Спадкоємність.* | ClinVar** | HGMD** |
---|---|---|---|---|
ADAM17 | Запальні захворювання шкіри та кишечника у новонароджених 1 | AR | 1 | 7 |
ALPI | Запальне захворювання кишечника | AR | 5 | |
CYP27A1 | Церебротендинозний ксантоматоз | AR | 69 | 110 |
DGAT1 | Діарея | AR | 7 | 11 |
EPCAM | Діарея 5, з тафтинговою ентеропатією, вроджена, колоректальний рак, спадковий неполіпоз | AD/AR | 38 | 80 |
FOXP3 | Імунодисрегуляція, поліендокринопатія та ентеропатія | XL | 28 | 93 |
GUCY2C | Діарея, меконіальний ілеус | AD/AR | 7 | 10 |
IL10 | Запальне захворювання кишечника | AD/AR | 1 | 5 |
IL10RA | Запальне захворювання кишечника | AR | 4 | 43 |
IL10RB | Запальне захворювання кишечника | AR | 2 | 19 |
IL21 | Імунодефіцит, загальна змінна, 11 | AR | 1 | 1 |
LCT | Дефіцит лактази | AR | 11 | 15 |
LIPA | Хвороба Вольмана, хвороба накопичення ефірів холестерину | AR | 27 | 93 |
MVK | Мевалонова ацидурія, синдром гіпер-IgD, порокератоз 3, кілька типів | AD/AR | 35 | 181 |
MYO5B | Діарея з атрофією мікроворсинок | AR | 14 | 80 |
NCF2 | Хронічна гранульоматозна хвороба | AR | 19 | 72 |
NEUROG3 | Діарея, мальабсорбція, вроджена | AR | 3 | 8 |
SAR1B | Хвороба затримки хіломікронів (хвороба Андерсона) | AR | 8 | 16 |
SI | Дефіцит сахарази-ізомальтази, уроджений | AR | 12 | 23 |
SKIV2L | Трихогепатоентеральний синдром 2 | AR | 6 | 33 |
SLC10A2 | Мальабсорбція жовчних кислот, первинна | AD/AR | 2 | 4 |
SLC26A3 | Діарея, секреція хлоридів, вроджена | AR | 55 | 88 |
SLC5A1 | Мальабсорбція глюкози/галактози | AR | 3 | 58 |
SLC9A3 | Діарея, секреторна натрієва, вроджена | AR | 6 | 12 |
SPINT2 | Діарея, секреторна натрієва, вроджена | AR | 6 | 12 |
STX3 | Хвороба включення мікроворсинок | AR | 3 | |
TTC37 | Трихогепатоентеральний синдром, синдром автозапальної панцитопенії | AR | 12 | 64 |
TTC7A | Шлунково-кишкові дефекти та синдром імунодефіциту | AR | 21 | 46 |
XIAP | Лімфопроліферативний синдром | XL | 14 | 96 |
* Тип успадкування: аутосомно-домінантний (AD), аутосомно-рецесивний (AR), мітохондріальний (mi), Х-зчеплений (XL), Х-зчеплений домінантний (XLD) та Х-зчеплений рецесивний (XLR); ** ClinVar, HGMD - кількість варіантів гена, класифікованих як патогенні або ймовірно патогенні в базі даних ClinVar, HGMD.
В панель дозволяється додати додаткові гени (до 200), пов'язані з симптомами, та видалити будь-які гени (щоб залишилося не менше 2). Вартість панелі може змінюватися, а саме:
- мала панель 2-25 генів ,
- середня панель 26-125 генів ,
- велика панель понад 126 генів .
Якщо аналіз виявив варіанти, що є можливою причиною хвороби, можна перевірити наявність цих варіантів у батьків. Аналіз окремих мутацій по Сенгеру.
Якщо аналіз не виявив варіантів, які є можливою причиною хвороби, можна розширити тестування до повного екзома Розширення панелі до повного екзома. Крім того, можна отримати сирі дані і робити повторну оцінку кожні кілька років. Можливо, згодом науці стануть відомі нові генетичні чинники захворювання.
Натще не потрібно, рясно пити воду.
Проводиться забір венозної крові в пробірку з ЕДТА 4 мл.
Забір матеріалу у нас у центрі або можна передати нам пробірку ЕДТА, взяту у будь-якій лабораторії. Про можливість забору у дітей уточнювати додатково.
У наших пунктах забору крім Києва забор матеріалу коштує .
Необхідно надати висновок лікаря з клінічною картиною (опис симтомів, діагноз), заповнити в електронному вигляді анкету.
Аналіз не проводиться для здорових людей без симптомів, у цьому випадку рекомендуються скринінгові аналізи на носійство.
За результатами секвенування необхідно отримати консультацію лікаря-генетика.