Аналізи ДНК в Україні
Всі аналізи/Панелі (секвенування NGS)
Панель бульозний епідермоліз - панель з 26 генів, яка включає оцінку некодуючих варіантів. Ідеально підходить для пацієнтів із клінічною підозрою на вроджений бульозний епідермоліз.
Бульозний епідермоліз являє собою групу спадкових захворювань, що характеризуються утворенням бульбашок на шкірі та слизових оболонках, що найчастіше виникають у місцях тертя та незначних травм, таких як стопи та руки. При деяких підтипах пухирі можуть з'являтися на внутрішніх органах, таких як стравохід, шлунок і дихальні шляхи.
Існує 4 основні типи бульозного епідермолізу, заснованих на різних ділянках утворення бульбашок у структурі шкіри:
Простий бульозний епідермоліз, СЕБ зазвичай характеризується ламкістю шкіри та рідко епітелію слизових оболонок, що призводить до утворення нерубцевих пухирів, спричинених легкою травмою або її відсутністю. Чотири найбільш поширені підтипи РЕВ: 1) локалізований (також відомий як тип Вебера-Коккейна); Біопсія шкіри зі свіжого пухиря вважається обов'язковою для діагностики генералізованих форм простого бульозного епідермолізу. Поширеність простого бульозного епідермолізу оцінюється в 1:30 000 - 50 000. Пенетрантність становить 100% для відомих мутацій KRT5 та KRT14. Було показано, що розташування мутацій у функціональних доменах KRT5 та KRT14 передбачає фенотип простого бульозного епідермолізу.
Сполучний бульозний епідермоліз, характеризується ламкістю шкіри та слизових оболонок, що проявляється утворенням бульбашок при незначній травмі або без неї. Утворення бульбашок може бути важким, а грануляційна тканина може утворюватися на шкірі навколо ротової та носової порожнин, пальців рук та ніг, а також усередині навколо верхніх дихальних шляхів. Викликається мутаціями у LAMB3 (70% всіх випадків), COL17A1 (12%), LAMC2 (9%) та LAMA3 (9%).
Дистрофічний бульозний епідермоліз викликається мутаціями COL7A1 і може бути домінантним або рецесивним. Домінатний зазвичай проявляється у легкій формі. Пухирі можуть бути локалізовані на руках, ногах, ліктях і колінах або можуть бути генералізованими. Рецесивний зазвичай більш генералізований і важкий, ніж домінантний.
Синдром Кіндлера зустрічається дуже рідко і вражає всі шари шкіри, характеризується крайньою крихкістю.
Ген | Асоційований фенотип | Спадкоємність.* | ClinVar** | HGMD** |
---|---|---|---|---|
ATP2C1 | Доброякісна хронічна пухирчатка | AD | 17 | 185 |
CDSN | Синдром лущення шкіри, гіпотрихоз | AD/AR | 6 | 14 |
COL17A1 | Епітеліальна рецидивна ерозійна дистрофія (ERED), бульозний епідермоліз, вузловий, не-Herlitz | AD/AR | 32 | 112 |
COL7A1 | Ураження нігтів, несиндромальне вроджене, Транзиторний бульозний дермоліз новонароджених, Дистрофічний бульозний епідермоліз, Претибіальний бульозний епідермоліз, Почесуточный бульозний епідермоліз | AD/AR | 159 | 816 |
CSTA | Синдром лущення шкіри 4 | AR | 5 | 6 |
DSG1 | Тяжкий дерматит, множинні алергії та синдром метаболічного виснаження (синдром SAM), смугастий долонно-підошовний кератоз I | AD/AR | 13 | 31 |
DSG2 | Аритмогенна дисплазія правого шлуночка, дилатаційна кардіоміопатія (ДКМП) | AD | 44 | 129 |
DSG4 | гіпотрихоз | AR | 8 | 18 |
DSP | Кардіоміопатія, дилатаційна, з вовняним волоссям, кератодермією та агенезією зубів, Аритмогенна дисплазія правого шлуночка, сімейна, Кардіоміопатія, дилатаційна, з вовняним волоссям та кератодермією, Ладонно-підошовний смугастий кератоз II, Бульозний епідермоліз, летальний акантолітичний | AD/AR | 177 | 296 |
DST | Невропатія, спадкова сенсорна та вегетативна | AR | 13 | 7 |
EXPH5 | Бульозний епідермоліз | AR | 2 | 10 |
FERMT1 | Синдром Кіндлера | AR | 32 | 83 |
GRIP1 | Синдром Фрейзера | AR | 5 | 17 |
ITGA3 | Інтерстиціальне захворювання легень з нефротичним синдромом та бульозним епідермолізом | AR | 6 | 11 |
ITGA6 | Бульозний епідермоліз, вузловий, зі стенозом воротаря | AR | 2 | 8 |
ITGB4 | Простий бульозний епідермоліз, Weber-Cockayne, бульозний епідермоліз, вузловий, з атрезією воротаря, бульозний епідермоліз, сполучний, не-Herlitz | AD/AR | 24 | 99 |
KLHL24 | Простий бульозний епідермоліз, генералізований, з рубцюванням та випаданням волосся, дилатаційна кардіоміопатія (ДКМП), гіпертрофічна кардіоміопатія (ГКМП) | AD/AR | 5 | 5 |
KRT1 | Ладонно-підошовна кератодермія, неепідермолітична, Іхтіоз, циклічний, з епідермолітичним гіперкератозом, Епідермолітичний гіперкератоз, Іхтіоз хістрікс, Керта-Макліна, Долонно-підошовний смугастий кератоз, Ладонно-підошвен | AD | 24 | 63 |
KRT14 | Простий бульозний епідермоліз, синдром Доулінга-Меара, простий бульозний епідермоліз, ретикулярна пігментна дерматопатія, простий бульозний епідермоліз, Вебер-Кокейн, простий бульозний епідермоліз, синдром Кебнера, синдром Негелі-Франческетt | AD/AR | 30 | 116 |
KRT5 | Простий бульозний епідермоліз, хвороба Доулінга-Меара, хвороба Доулінга-Дегоса, простий бульозний епідермоліз з мігруючою кільцеподібною еритемою, простий бульозний епідермоліз з плямистою пігментацією, простий бульозний епідермоліз, хвороба хвороба Кебнера, простий бульозний епідермоліз, аутосомно-рецесивний | AD/AR | 38 | 152 |
LAMA3 | Бульозний епідермоліз, вузловий, Herlitz, бульозний епідермоліз, генералізований атрофічний доброякісний, ларингооніхошкірний синдром | AR | 88 | 55 |
LAMB3 | Недосконалий амелогенез, бульозний епідермоліз, сполучний, Herlitz, бульозний епідермоліз, сполучний, не Herlitz | AD/AR | 84 | 118 |
LAMC2 | Бульозний епідермоліз, вузловий, Herlitz, Бульозний епідермоліз, вузловий, не Herlitz | AR | 55 | 41 |
PKP1 | Ектодермальна дисплазія/синдром крихкості шкіри | AR | 5 | 18 |
PLEC | М'язова дистрофія, кінцево-поясна, бульозний епідермоліз | AD/AR | 36 | 103 |
TGM5 | Синдром лущення шкіри | AR | 10 | 25 |
* Тип успадкування: аутосомно-домінантний (AD), аутосомно-рецесивний (AR), мітохондріальний (mi), Х-зчеплений (XL), Х-зчеплений домінантний (XLD) та Х-зчеплений рецесивний (XLR); ** ClinVar, HGMD - кількість варіантів гена, класифікованих як патогенні або ймовірно патогенні в базі даних ClinVar, HGMD.
В панель дозволяється додати додаткові гени (до 200), пов'язані з симптомами, та видалити будь-які гени (щоб залишилося не менше 2). Вартість панелі може змінюватися, а саме:
- мала панель 2-25 генів ,
- середня панель 26-125 генів ,
- велика панель понад 126 генів .
Якщо аналіз виявив варіанти, що є можливою причиною хвороби, можна перевірити наявність цих варіантів у батьків. Аналіз окремих мутацій по Сенгеру.
Якщо аналіз не виявив варіантів, які є можливою причиною хвороби, можна розширити тестування до повного екзома Розширення панелі до повного екзома. Крім того, можна отримати сирі дані і робити повторну оцінку кожні кілька років. Можливо, згодом науці стануть відомі нові генетичні чинники захворювання.
Натще не потрібно, рясно пити воду.
Проводиться забір венозної крові в пробірку з ЕДТА 4 мл.
Забір матеріалу у нас у центрі або можна передати нам пробірку ЕДТА, взяту у будь-якій лабораторії. Про можливість забору у дітей уточнювати додатково.
У наших пунктах забору крім Києва забор матеріалу коштує .
Необхідно надати висновок лікаря з клінічною картиною (опис симтомів, діагноз), заповнити в електронному вигляді анкету.
Аналіз не проводиться для здорових людей без симптомів, у цьому випадку рекомендуються скринінгові аналізи на носійство.
За результатами секвенування необхідно отримати консультацію лікаря-генетика.