Аналізи ДНК в Україні
Всі аналізи/Панелі (секвенування NGS)
У панель "Розумна відсталість та розлади аутистичного спектру" входить 75 генів, також включена оцінка некодуючих варіантів, виявлення делецій та дуплікацій (ХМА), успадкований від матері мітохондріальний геном.
Ідеальна панель для пацієнтів із клінічною підозрою на аутизм чи розумову відсталість.
Розлад аутистичного спектру (РАС) — це порушення розвитку нервової системи, що характеризується дефіцитом соціального спілкування, відсутністю або затримкою мовного розвитку, а також стереотипною або поведінкою, що повторюється. У аутизму багато етіологій, оскільки він був задокументований у сотнях неврологічних синдромів із безліччю причин, наслідків та реакцій на лікування. Нині генетичну причину можна виявити у 20-25% дітей із аутизмом. Моногенні розлади, при яких неврологічні прояви пов'язані з розладом аутистичного спектру (РАС), можуть бути ідентифіковані приблизно у 5% пацієнтів із РАС. Аутизм можна розглядати як комплексний (тобто наявність дисморфічних ознак та/або мікроцефалії) або есенціальний (тобто відсутність фізичних аномалій та мікроцефалії).
Ген | Асоційований фенотип | Спадкоємність.* | ClinVar** | HGMD** |
---|---|---|---|---|
ADNP | Синдром Хельсмуртеля-ван дер Аа (розумова відсталість, аутосомно-домінантний 28) | AD | 44 | 66 |
BCL11A | Синдром Діаса-Логана | AD | 20 | 29 |
C12ORF4 | Затримка розвитку та судоми з руховими порушеннями або без них (DEDSM) | AR | 1 | 5 |
CACNA1C | Синдром Бругада, синдром Тімоті, порушення розвитку нервової системи | AD | 19 | 68 |
CC2D1A | Розумова відсталість, аутосомно-рецесивна 3 | AR | 3 | 7 |
CNOT3 | AD | 1 | 8 | |
CNTN6 | Затримка розвитку та судоми з руховими порушеннями або без них (DEDSM) | AD | 2 | 41 |
COL4A3BP | Розумова відсталість, аутосомно-домінантний 34 | AD | 6 | 7 |
CSNK2A1 | AD | 14 | 20 | |
CTNND2 | Затримка розвитку та судоми з руховими порушеннями або без них (DEDSM) | AD | 7 | 35 |
DHCR7 | Синдром Сміта-Лемлі-Опіца | AR | 88 | 217 |
EHMT1 | Синдром Кліфстри | AD | 86 | 89 |
EN2 | Аутизм | AD | 2 | |
FBXO11 | Порушення інтелектуального розвитку | AD | 8 | 9 |
FOXP1 | Розумова відсталість з порушенням мови та аутистичними рисами, Вроджені вади серця | AD | 48 | 76 |
GAMT | Дефіцит гуанідиноацетатметилтрансферази | AR | 18 | 58 |
KMT2E | AD | 4 | ||
KMT5B | Затримка розвитку та судоми з руховими аномаліями або без них (DEDSM), розлад аутистичного спектру, синдром надмірного зростання з розумовою відсталістю | AD | 9 | 14 |
MBOAT7 | Розумова відсталість, аутосомно-рецесивна 57 | AR | 5 | 5 |
MECP2 | Синдром Ангельмана, Аутизм, Синдром Ретта, Енцефалопатія, Розумова відсталість | XL | 506 | 1039 |
MT-ATP6 | Нейропатія, атаксія та пігментний ретиніт, спадкова оптична невропатія Лебера, атаксія та полінейропатія, дорослий початок, кардіоміопатія, інфантильна гіпертрофічна, синдром Лі, стріатонігральна дегенерація, інфантильна, мітохондріальна | Mitochondrial | 19 | |
MT-ATP8 | Кардіоміопатія, апікальна гіпертрофічна та нейропатія, Кардіоміопатія, інфантильна гіпертрофічна | Mitochondrial | 4 | |
MT-CO1 | Міоглобінурія, рецидивна, спадкова оптична нейропатія Лебера, сидеробластна анемія, дефіцит цитохром-С-оксидази, глухота, мітохондріальна | Mitochondrial | 17 | |
MT-CO2 | Дефіцит цитохрому з оксидази | Mitochondrial | 8 | |
MT-CO3 | Дефіцит цитохрому з оксидази, спадкова оптична нейропатія Лебера | Mitochondrial | 9 | |
MT-CYB | Mitochondrial | 69 | ||
MT-ND1 | Мітохондріальна міопатія, енцефалопатія, лактоацидоз та інсультоподібні епізоди, спадкова оптична нейропатія Лебера, атрофія та дистонія зорового нерва Лебера | Mitochondrial | 21 | |
MT-ND2 | Спадкова оптична нейропатія Лебера, дефіцит мітохондріального комплексу I | Mitochondrial | 6 | |
MT-ND3 | Атрофія та дистонія зорового нерва Лебера, дефіцит мітохондріального комплексу I | Mitochondrial | 7 | |
MT-ND4 | Спадкова оптична нейропатія Лебера, атрофія та дистонія зорового нерва Лебера, дефіцит мітохондріального комплексу I | Mitochondrial | 11 | |
MT-ND4L | Спадкова оптична нейропатія Лебера | Mitochondrial | 2 | |
MT-ND5 | Міоклонічна епілепсія з рваними червоними волокнами, мітохондріальна міопатія, енцефалопатія, лактоацидоз та інсультоподібні епізоди, спадкова оптична нейропатія Лебера, дефіцит мітохондріального комплексу I | Mitochondrial | 19 | |
MT-ND6 | Мітохондріальна міопатія, енцефалопатія, лактоацидоз та інсультоподібні епізоди, онкоцитома, спадкова оптична нейропатія Лебера, атрофія та дистонія зорового нерва Лебера, дефіцит мітохондріального комплексу I | Mitochondrial | 16 | |
MT-RNR1 | Глухота, мітохондріальна | Mitochondrial | 3 | |
MT-RNR2 | Токсичність/резистентність до хлорамфеніколу | Mitochondrial | 2 | |
MT-TA | Mitochondrial | 4 | ||
MT-TC | Мітохондріальна міопатія, енцефалопатія, лактоацидоз та інсультоподібні епізоди | Mitochondrial | 3 | |
MT-TD | Mitochondrial | 1 | ||
MT-TE | Діабет-синдром глухоти, Мітохондріальна міопатія, інфантильна, транзиторна, Мітохондріальна міопатія при цукровому діабеті | Mitochondrial | 5 | |
MT-TF | Міоклонічна епілепсія з рваними червоними волокнами, нефропатія, тубулоінтерстиціальна, енцефалопатія, мітохондріальна, епілепсія, мітохондріальна, міопатія, мітохондріальна, мітохондріальна енцефаломіопатія з ілактоацид | Mitochondrial | 7 | |
MT-TG | Mitochondrial | 3 | ||
MT-TH | Mitochondrial | 4 | ||
MT-TI | Mitochondrial | 7 | ||
MT-TK | Міоклонічна епілепсія з рваними червоними волокнами, синдром Лея | Mitochondrial | 5 | |
MT-TL1 | Дефіцит цитохром-с-оксидази, міоклонічна епілепсія з рваними червоними волокнами, мітохондріальна міопатія, енцефалопатія, лактоацидоз та інсультоподібні епізоди, діабет-синдром глухоти, синдром циклічного блювання, СВДС | Mitochondrial | 14 | |
MT-TL2 | Мітохондріальне мультисистемне захворювання, прогресуюча зовнішня офтальмоплегія, мітохондріальна міопатія, мітохондріальна енцефаломіопатія з лактоацидозом та інсультоподібними епізодами | Mitochondrial | 5 | |
MT-TM | Синдром Лея, мітохондріальний мультисистемний розлад | Mitochondrial | 1 | |
MT-TN | Прогресуюча зовнішня офтальмоплегія, мітохондріальне мультисистемне захворювання | Mitochondrial | 3 | |
MT-TP | Mitochondrial | 2 | ||
MT-TQ | Мітохондріальний мультисистемний розлад | Mitochondrial | 2 | |
MT-TR | Енцефалопатія, мітохондріальна | Mitochondrial | 2 | |
MT-TS1 | Міоклонічна епілепсія з рваними червоними волокнами, мітохондріальна міопатія, енцефалопатія, лактоацидоз та інсультоподібні епізоди | Mitochondrial | 10 | |
MT-TS2 | Мітохондріальний мультисистемний розлад | Mitochondrial | 2 | |
MT-TT | Mitochondrial | 5 | ||
MT-TV | Гіпертрофічна кардіоміопатія (ГКМП), синдром Лі, мітохондріальне мультисистемне захворювання, мітохондріальнаенцефаломіопатія з лактоацидозом та інсультоподібними епізодами | Mitochondrial | 3 | |
MT-TW | Синдром Лі, міопатія, мітохондріальна | Mitochondrial | 8 | |
MT-TY | Мітохондріальний мультисистемний розлад | Mitochondrial | 4 | |
NBEA | Епілепсія | AD | 3 | 13 |
NFIB | Макроцефалія | AD | 17 | 2 |
NLGN3 | Аутизм, синдром Аспергера | XL | 2 | 10 |
NLGN4X | Аутизм, синдром Аспергера, розумова відсталість | XL | 7 | 35 |
NSD1 | синдром Сотоса, синдром Уівера, синдром Беквіта-Відеманна | AD | 329 | 517 |
POGZ | Розумова відсталість, аутосомно-домінантний 37 (синдром Уайта-Саттона) | AD | 46 | 52 |
PTCHD1 | Схильність до аутизму, зчеплений з Х-хромосомою 4 | XL | 9 | 47 |
PTEN | синдром Баннана-Райлі-Рувалькаба, синдром Лермітта-Дюкло, синдром Каудену | AD | 435 | 638 |
RPL10 | Аутизм | XL | 4 | 5 |
SHANK3 | Синдром Фелана-Макдерміда, шизофренія 15 | AD | 66 | 191 |
TBR1 | AD | 16 | 18 | |
TCF20 | Затримка розвитку та судоми з руховими порушеннями або без них (DEDSM) | AD | 7 | 16 |
TRIP12 | Порушення інтелектуального розвитку | AD | 14 | 32 |
TSC1 | Лімфангіолейоміоматоз, Туберозний склероз | AD | 177 | 372 |
TSC2 | Лімфангіолейоміоматоз, Туберозний склероз | AD | 396 | 1195 |
VAMP2 | AD | |||
WASF1 | Розумова відсталість та судоми | AD | 3 | 3 |
ZSWIM6 | Акрометичний лобово-носовий дизостоз | AD | 4 | 2 |
* Тип успадкування: аутосомно-домінантний (AD), аутосомно-рецесивний (AR), мітохондріальний (mi), Х-зчеплений (XL), Х-зчеплений домінантний (XLD) та Х-зчеплений рецесивний (XLR); ** ClinVar, HGMD - кількість варіантів гена, класифікованих як патогенні або ймовірно патогенні в базі даних ClinVar, HGMD.
В панель дозволяється додати додаткові гени (до 200), пов'язані з симптомами, та видалити будь-які гени (щоб залишилося не менше 2). Вартість панелі може змінюватися, а саме:
- мала панель 2-25 генів ,
- середня панель 26-125 генів ,
- велика панель понад 126 генів .
Якщо аналіз виявив варіанти, що є можливою причиною хвороби, можна перевірити наявність цих варіантів у батьків. Аналіз окремих мутацій по Сенгеру.
Якщо аналіз не виявив варіантів, які є можливою причиною хвороби, можна розширити тестування до повного екзома Розширення панелі до повного екзома. Крім того, можна отримати сирі дані і робити повторну оцінку кожні кілька років. Можливо, згодом науці стануть відомі нові генетичні чинники захворювання.
Натще не потрібно, рясно пити воду.
Проводиться забір венозної крові в пробірку з ЕДТА 4 мл.
Забір матеріалу у нас у центрі або можна передати нам пробірку ЕДТА, взяту у будь-якій лабораторії. Про можливість забору крові у дітей уточнювати додатково.
У наших пунктах забору крім Києва забор матеріалу коштує .
Необхідно надати висновок лікаря з клінічною картиною (опис симтомів, діагноз), заповнити в електронному вигляді анкету.
Аналіз не проводиться для здорових людей без симптомів, у цьому випадку рекомендуються скринінгові аналізи на носійство.
За результатами секвенування необхідно отримати консультацію лікаря-генетика.