Аналізи ДНК в Україні
Всі аналізи/Панелі (секвенування NGS)
В панель „Панель аномальних геніталій/розладів статевого розвитку“ входить 73 гени, також включена оцінка некодуючих варіантів, виявлення делецій та дуплікацій.
Ідеально підходить для пацієнтів з неоднозначними геніталіями, пацієнтів із підозрою на порушення статевого розвитку та пацієнтів із підозрою на вроджену гіперплазію надниркових залоз (ВГКН).
Порушення статевого розвитку (DSD) є групою вроджених станів, що характеризуються проблемами в ході формування гонадного та статевого розвитку. Було підраховано, що від 1% до 2% живонароджених мають будь-який аспект DSD. Приблизно 5% дітей з DSD мають неоднозначні геніталії та невизначену стать при народженні. Однак переважній більшості цих пацієнтів не потрібна хірургія, що коригує. Пацієнти з DSD 46,XY часто мають порушення синтезу або дії андрогенів і можуть мати нормальні жіночі зовнішні статеві органи, тоді як пацієнти з DSD 46,XX станами часто мають надлишок андрогенів. У жінок 46,XX вроджена гіперплазія кори надниркових залоз (ВГН), викликана дефіцитом 21-гідроксилази (21-OHD), є найчастішою причиною DSD. За оцінками, поширеність ВГКН становить 1:10 000, а 90-95% випадків пов'язані з мутаціями CYP21A2. Тяжкість стану часто залежить від залишкової ферментативної активності, що підрозділяє мутації CYP21A2 на тяжкі (класичний фенотип, ферментативна активність 0-10%) та легкі (некласичні, ферментативна активність 20-50%).
Синдром нечутливості до андрогенів (AIS), викликаний мутаціями в AR, характеризується фемінізацією зовнішніх статевих органів та атиповим статевим розвитком у осіб з каріотипом 46,XY. Стан може бути повним, частковим або легким залежно від рівня нечутливості до андрогенів. Мутації в гені AR пояснюють до 95% випадків повної нечутливості до андрогенів, тоді як для часткового та легкого підтипів цей показник є нижчим. Загальна поширеність різних підтипів AIS оцінюється як 5:100 000.
Ген | Асоційований фенотип | Спадкоємність.* | ClinVar** | HGMD** |
---|---|---|---|---|
AMH | Синдром персистуючої мюллерової протоки | AR | 5 | 56 |
AMHR2 | Синдром персистуючої мюллерової протоки | AR | 6 | 37 |
ANOS1 | синдром Каллмана | XL/Digenic | 36 | 186 |
AR | Нечутливість до андрогенів, гіпоспадія 1, зчеплена з Х-хромосомою | XL | 147 | 612 |
ARX | Ліссенцефалія, епілептична енцефалопатія, мозолисте тіло, агенезія, з аномаліями геніталій, синдром Партингтона, синдром Прауда, гідрененцефалія з аномаліями геніталій, розумова відсталість | XL | 66 | 93 |
ATRX | синдром Карпентера-Вазірі, альфа-таласемія/синдром розумової відсталості, синдром Холмса-Ганга, синдром Джуберга-Марсіді, синдром Сміта-Файнмана-Майєрса, синдром розумової відсталості-гіпотонічної особи | XL | 65 | 165 |
BCOR | Мікрофтальм, синдромальний, окулофаціокардіодентальний синдром | XL | 40 | 53 |
CDK9 | AR | 1 | ||
CDKN1C | Синдром Беквіта-Відеманна, синдром IMAGE | AD | 35 | 81 |
CEP41 | синдром Жубера | AR/Digenic | 7 | 11 |
CHD4 | Синдром Сіфріма-Хітца-Вейса | AD | 14 | 21 |
CHD7 | Ізольований дефіцит гонадотропін-рилізинг-гормону, CHARGE-синдром | AD | 276 | 860 |
CREBBP | Синдром Рубінштейна-Тайбі | AD | 175 | 362 |
CYB5A | 46, XY порушення розвитку статі, метгемоглобінемія, тип IV | AR | 3 | 5 |
CYP11A1 | Надниркова недостатність, вроджена, зі зміною статі 46,XY, часткова або повна | AD/AR | 14 | 28 |
CYP11B1 | Гіперплазія надниркових залоз, вроджена, через дефіцит 11-бета-гідроксилази, що коригується глюкокортикоїдами альдостеронізм | AD/AR | 55 | 147 |
CYP17A1 | Вроджена гіперплазія надниркових залоз через дефіцит 17-альфа-гідроксилази | AR | 35 | 126 |
CYP19A1 | Дефіцит ароматази, синдром надлишку ароматази | AR | 17 | 52 |
CYP21A2 | Гіперплазія надниркових залоз, вроджена, обумовлена дефіцитом 21-гідроксилази, Гіперандрогенія, некласична, обумовлена дефіцитом 21-гідроксилази | AR | 48 | 296 |
DHCR7 | Синдром Сміта-Лемлі-Опіца | AR | 88 | 217 |
DHH | 46,XY часткова дисгенезія статевих залоз з мініфасцикулярною невропатією, 46,XY реверсія статі 7 | AD/AR | 5 | 18 |
DYNC2H1 | Короткореберна дисплазія грудної клітини з полідактилією 1 типу або без неї, Короткореберна дисплазія грудної клітини з полідактилією 3 типу або без неї, Асфіксувальна грудна дисплазія (ATD; Jeune), SRPS тип 2 (Majewski) | AR/Digenic | 148 | 205 |
ERCC3 | пігментна ксеродерма, трихотіодистрофія, світлочутливість | AR | 10 | 19 |
FEZF1 | Гіпогонадотропний гіпогонадизм 22 з аносмією або без неї, синдром Каллмана | AR | 2 | 3 |
FGF17 | Гіпогонадотропний гіпогонадизм 20, з аносмією або без неї | AD/Multigenic | 2 | 5 |
FGF8 | Гіпогонадотропний гіпогонадизм | AD/Digenic | 18 | 36 |
FGFR1 | синдром Пфайффера, тригоноцефалія, гіпогонадотропний гіпогонадизм, остеоглофонічна карликовість - краніостеноз, синдром Хартсфілда | AD/Digenic/Multigenic | 72 | 257 |
FIG4 | Бічний аміотрофічний склероз, полімікрогірія, двостороння потилична, синдром Юніса-Варона, хвороба Шарко-Марі-Тута | AD/AR | 34 | 69 |
FRAS1 | Синдром Фрейзера | AR | 27 | 58 |
FSHB | Гіпогонадотропний гіпогонадизм 24 без аносмії | AR | 5 | 8 |
GATA4 | Тетрада Фалло, дефект атріовентрикулярної перегородки, аномалії яєчок з вродженою пороком серця або без нього, дефект міжшлуночкової перегородки, дефект міжпередсердної перегородки | AD | 37 | 140 |
GNRH1 | Гіпогонадотропний гіпогонадизм 12 з аносмією або без неї | AR | 1 | 10 |
GNRHR | Гіпогонадотропний гіпогонадизм | AR | 23 | 58 |
HS6ST1 | Гіпогонадотропний гіпогонадизм 15, з аносмією або без неї, синдром Каллмана | AD | 7 | |
HSD17B3 | Порушення розвитку нервової системи з гіпотонією, неонатальною дихальною недостатністю та термодисрегуляцією | AR | 24 | 63 |
HSD3B2 | 3-бета-гідроксистероїддегідрогеназа, дефіцит II | AR | 11 | 63 |
IL17RD | Гіпогонадотропний гіпогонадизм | AD/Digenic | 6 | 10 |
IRF6 | Орофаціальна ущелина, синдром підколінного птеригіуму, синдром Ван дер Вуда | AD | 45 | 338 |
KISS1 | Гіпогонадотропний гіпогонадизм 13 з аносмією або без неї, центральне передчасне статеве дозрівання | AR | 1 | 10 |
KISS1R | Передчасове статеве дозрівання, центральне 1 | AD/AR | 7 | 36 |
LEP | Дефіцит лептину | AR | 5 | 20 |
LEPR | Дефіцит рецептора лептину | AR | 4 | 30 |
LHB | Гіпогонадотропний гіпогонадизм 23 з аносмією або без неї | AR | 6 | 8 |
LHCGR | Передчасове статеве дозрівання, чоловіки, гіпоплазія клітин Лейдіга, резистентність до лютеїнізуючого гормону, жінки | AR | 34 | 76 |
MAMLD1 | Гіпоспадія 2, зчеплена з Х-хромосомою | XL | 5 | 20 |
MAP3K1 | 46,XY зміна підлоги 6 | AD | 9 | 27 |
MKRN3 | Центральне передчасне статеве дозрівання | AD | 6 | 32 |
MKS1 | синдром Барде-Бідля, синдром Меккеля | AR | 50 | 52 |
NR0B1 | Гіпоплазія надниркових залоз, вроджена, зміна статі 46, XY | XL | 73 | 252 |
NR5A1 | Надниркова недостатність, передчасна недостатність яєчників, 46, XY зміна статі | AD | 28 | 183 |
NSMF | Гіпогонадотропний гіпогонадизм 9 з аносмією або без неї | AD | 8 | |
POLR3B | Лейкодистрофія, гіпомієлінізуюча | AR | 19 | 58 |
POR | Порушення стероїдогенезу через дефіцит цитохрому р450 оксидоредуктази, синдром Антлі-Бікслера | AR | 14 | 70 |
PROK2 | Гіпогонадизм, гіпогонадотропний, синдром Каллмана | AR | 7 | 20 |
PROKR2 | Гіпогонадотропний гіпогонадизм | AR | 9 | 54 |
PROP1 | Дефіцит гормонів гіпофіза, комбінований | AR | 33 | 37 |
RNF216 | Мозочкова атаксія та гіпогонадотропний гіпогонадизм (синдром Гордона Холмса) | AR | 10 | 14 |
RSPO1 | Ладонно-підошовний гіперкератоз з плоскоклітинним раком шкіри та реверсією підлоги 46, XX | AR | 3 | 5 |
SAMD9 | синдром міражу, пухлинний кальциноз, нормофосфатемія | AD/AR | 10 | 27 |
SGPL1 | Нефротичний синдром 14 | AR | 8 | 17 |
SOX10 | Периферична демієлінізуюча невропатія, центральна дисмієлінізація, синдром Ваарденбурга та хвороба Гіршпрунга, синдром Каллмана | AD | 56 | 148 |
SOX2 | Мікрофтальм, синдромальний | AD | 34 | 104 |
SOX9 | Кампомелічна дисплазія, зміна статі 46,XY, брахідактилія з аноніхією (синдром Кука) | AD | 47 | 144 |
SRD5A2 | Дефіцит стероїдної 5-альфа-редуктази 2 | AR | 45 | 119 |
SRY | 46,XX порушення статевого розвитку, 46,XY порушення статевого розвитку | YL | 29 | 109 |
STAR | Ліпоїдна гіперплазія надниркових залоз | AR | 34 | 83 |
TAC3 | Гіпогонадотропний гіпогонадизм | AR | 5 | 10 |
TACR3 | Гіпогонадотропний гіпогонадизм | AR | 8 | 36 |
TOE1 | Мостомозочкова гіпоплазія 7 типу | 11 | 12 | |
TSPYL1 | Раптова смерть дитини при синдромі дисгенезії яєчок, 46 років, XY порушення статевого розвитку | AR | 1 | 8 |
WDR11 | Гіпогонадотропний гіпогонадизм, синдром Каллмана | AD | 3 | 17 |
WT1 | Синдром Дені-Драша, синдром Фрейзера, пухлина Вільмса, нефротичний синдром, тип 4 | AD | 42 | 183 |
ZFPM2 | 46, XY зміна статі, діафрагмальна грижа 3, зошит Фалло | AD/AR | 9 | 50 |
* Тип успадкування: аутосомно-домінантний (AD), аутосомно-рецесивний (AR), мітохондріальний (mi), Х-зчеплений (XL), Х-зчеплений домінантний (XLD) та Х-зчеплений рецесивний (XLR); ** ClinVar, HGMD - кількість варіантів гена, класифікованих як патогенні або ймовірно патогенні в базі даних ClinVar, HGMD.
В панель дозволяється додати додаткові гени (до 200), пов'язані з симптомами, та видалити будь-які гени (щоб залишилося не менше 2). Вартість панелі може змінюватися, а саме:
- мала панель 2-25 генів ,
- середня панель 26-125 генів ,
- велика панель понад 126 генів .
Якщо аналіз виявив варіанти, що є можливою причиною хвороби, можна перевірити наявність цих варіантів у батьків. Аналіз окремих мутацій по Сенгеру.
Якщо аналіз не виявив варіантів, які є можливою причиною хвороби, можна розширити тестування до повного екзома Розширення панелі до повного екзома. Крім того, можна отримати сирі дані і робити повторну оцінку кожні кілька років. Можливо, згодом науці стануть відомі нові генетичні чинники захворювання.
Натще не потрібно, рясно пити воду.
Проводиться забір венозної крові в пробірку з ЕДТА 4 мл.
Забір матеріалу у нас у центрі або можна передати нам пробірку ЕДТА, взяту у будь-якій лабораторії. Про можливість забору у дітей уточнювати додатково.
У наших пунктах забору крім Києва забор матеріалу коштує .
Необхідно надати висновок лікаря з клінічною картиною (опис симтомів, діагноз), заповнити в електронному вигляді анкету.
Аналіз не проводиться для здорових людей без симптомів, у цьому випадку рекомендуються скринінгові аналізи на носійство.
За результатами секвенування необхідно отримати консультацію лікаря-генетика.