Аналізи ДНК в Україні
Всі аналізи/Панелі (секвенування NGS)
В панель MODY диабет входит 54 гена, а также включены возможности некодирования, обнаружения делений и дукаплиций. Она также включает ненаблюдаемый по ручьевым линиям митохондриальный геном. Идеально подходит для пациентов с подозрением на диабет зрелого возраста (MODY).
Діабет молодого віку з початком в зрілості (MODY) є аутосомно-домінантною спадковою формою діабету, на яку припадає 1–2% осіб із діабетом. MODY — це рідкісна клінічно та генетично гетерогенна форма діабету, яка характеризується молодим віком початку (зазвичай 10-45 років), з розвитком інсулінонезалежного діабету до 25 років. Крім того, також були відзначені аномалії кровоносних судин сітківки (ретинопатія) і нирок, а також вроджені аномалії внаслідок ускладнень діабету. Особи з MODY зазвичай не мають історії ожиріння або метаболічного синдрому, що супроводжує гіперглікемію. Багатьом людям з MODY неправильно діагностують діабет 1 або 2 типу. MODY є найпоширенішою формою моногенного діабету з оцінками поширеності 1:10 000 у дорослих і 1:23 000 у дітей. Приблизно у 80% випадків діагностується діабет 1 або 2 типу, що ускладнює оцінку поширеності та захворюваності. Генетичне тестування, як правило, проводиться лише у тих, хто має класичні ознаки MODY. Однак лише 50% суб’єктів із генетично діагностованим MODY відповідають класичним критеріям. Встановлення діагнозу MODY значно впливає на клінічне лікування. Гетерозиготні мутації в HNF1A, HNF4A та GCK становлять >90% усіх MODY з відомою генетичною причиною. Пацієнти з мутаціями HNF1A та HNF4A мають повільно прогресуючу дисфункцію бета-клітин, і лікування низькими дозами сульфонілсечовини призводить до стабільного або покращеного контролю глікемії та покращення якості життя, пов’язаного з лікуванням діабету, порівняно з терапією інсуліном або метформіном. GCK-MODY має унікальний фенотип легкої непрогресуючої гіперглікемії з HbA1c зазвичай <7% (53 ммоль/моль). Це не пов’язано з підвищеним ризиком мікросудинних і макросудинних ускладнень, які спостерігаються при інших формах діабету. Як правило, лікування не змінює HbA1c. Молекулярна діагностика GCK-MODY дозволяє припинити фармакологічну терапію та зменшує частоту медичного спостереження. (PMID: 24026547).
Ген | Асоційований фенотип | Спадкування* | ClinVar** | HGMD** |
---|---|---|---|---|
ABCC8 | Гіперінсулінемічна гіпоглікемія, діабет, постійна неонатальна, гіпоглікемія, індукована лейцином, цукровий діабет, транзиторна неонатальна, легенева артеріальна гіпертензія (ЛАГ) | AD/AR | 170 | 641 |
APPL1 | Цукровий діабет молодого віку, тип 14 | AD | 2 | 2 |
BLK | Діабет зрілого віку молодого віку | AD | 5 | 9 |
CEL* | Цукровий діабет молодого віку, тип 8 | AD | 4 | 13 |
GATA6 | Вади серця, вроджені та інші вроджені аномалії, дефект міжпередсердної перегородки 9, дефект атріовентрикулярної перегородки 5, стійкий артеріальний стовбур, тетралогія Фалло | AD | 16 | 82 |
GCK | Гіперінсулінемічна гіпоглікемія, сімейна, цукровий діабет, постійний неонатальний, діабет молодого віку, тип 2 | AD/AR | 178 | 837 |
HNF1A | Діабет зрілого віку молодого віку | AD | 78 | 528 |
HNF1B | Нирково-клітинна карцинома, непапілярний хромофоб, ниркові кісти та цукровий діабет | AD | 35 | 234 |
HNF4A | Вроджений гіперінсулінізм, чутливий до діазоксиду, зрілий діабет у молодому віці, ренотубулярний синдром Фанконі 4 із зрілим діабетом у молодому віці | AD | 32 | 147 |
INS | Цукровий діабет, постійний неонатальний, гіперпроінсулінемія, сімейний, з діабетом або без нього, цукровий діабет у зрілому віці молодого віку | AD/AR | 33 | 78 |
KCNJ11 | Гіперінсулінемічна гіпоглікемія, діабет, постійний неонатальний, цукровий діабет, транзиторний неонатальний, діабет у зрілому віці 13 років, успадковані від батька мутації можуть спричинити вогнищеву аденоматозну гіперплазію | AD/AR | 63 | 178 |
KLF11 | Діабет зрілого віку молодого віку | AD | 1 | 4 |
MT-ATP6 | Нейропатія, атаксія та пігментний ретиніт, спадкова нейропатія зорового нерва Лебера, атаксія та поліневропатія, початок у дорослому віці, кардіоміопатія, інфантильна гіпертрофія, синдром Лея, стріатонігральна дегенерація, інфантильна, мітохондріальна | Мітохондріальний | 19 | |
MT-ATP8 | Кардіоміопатія, апікальна гіпертрофічна та нейропатія, Кардіоміопатія, інфантильна гіпертрофічна | Мітохондріальний | 4 | |
MT-CO1 | Міоглобінурія, рецидивна, спадкова нейропатія зорового нерва Лебера, сидеробластна анемія, дефіцит цитохром С-оксидази, глухота, мітохондріальна | Мітохондріальний | 17 | |
MT-CO2 | Дефіцит цитохром-с-оксидази | Мітохондріальний | 8 | |
MT-CO3 | Дефіцит цитохром-с-оксидази, спадкова невропатія зорового нерва Лебера | Мітохондріальний | 9 | |
MT-CYB | Мітохондріальний | 69 | ||
MT-ND1 | Мітохондріальна міопатія, енцефалопатія, лактоацидоз та інсультоподібні епізоди, спадкова невропатія зорового нерва Лебера, атрофія зорового нерва Лебера та дистонія | Мітохондріальний | 21 | |
MT-ND2 | Спадкова невропатія зорового нерва Лебера, дефіцит мітохондріального комплексу I | Мітохондріальний | 6 | |
MT-ND3 | Атрофія та дистонія Лебера, дефіцит мітохондріального комплексу I | Мітохондріальний | 7 | |
MT-ND4 | Спадкова нейропатія зорового нерва Лебера, атрофія зорового нерва та дистонія Лебера, мітохондріальний комплекс I dефективність | Мітохондріальний | 11 | |
MT-ND4L | Спадкова нейропатія зорового нерва Лебера | Мітохондріальний | 2 | |
MT-ND5 | Міоклонічна епілепсія з обірваними червоними волокнами, мітохондріальна міопатія, енцефалопатія, лактоацидоз та інсультоподібні епізоди, спадкова нейропатія зорового нерва Лебера, дефіцит мітохондріального комплексу I | Мітохондріальний | 19 | |
MT-ND6 | Мітохондріальна міопатія, енцефалопатія, лактоацидоз та інсультоподібні епізоди, онкоцитома, спадкова нейропатія зорового нерва Лебера, атрофія зорового нерва та дистонія Лебера, дефіцит мітохондріального комплексу I | Мітохондріальний | 16 | |
MT-RNR1 | Мітохондріальна глухота | Мітохондріальний | 3 | |
MT-RNR2 | Токсичність/стійкість до хлорамфеніколу | Мітохондріальний | 2 | |
MT-TA | Мітохондріальний | 4 | ||
MT-TC | Мітохондріальна міопатія, енцефалопатія, лактоацидоз та інсультоподібні епізоди | Мітохондріальний | 3 | |
MT-TD | Мітохондріальний | 1 | ||
МТ-ТЕ | Діабет-синдром глухоти, мітохондріальна міопатія, інфантильна, тимчасова, мітохондріальна міопатія з діабетом | Мітохондріальний | 5 | |
MT-TF | Міоклонічна епілепсія з нерівними червоними волокнами, нефропатія, тубулоінтерстиціальна, енцефалопатія, мітохондріальна, епілепсія, мітохондріальна, міопатія, мітохондріальна, мітохондріальна енцефаломіопатія з молочнокислим ацидозом та інсультоподібними епізодами | Мітохондріальний | 7 | |
MT-TG | Мітохондріальний | 3 | ||
MT-TH | Мітохондріальний | 4 | ||
MT-TI | Мітохондріальний | 7 | ||
МТ-ТЗ | Міоклонічна епілепсія з нерівними червоними волокнами, синдром Лея | Мітохондріальний | 5 | |
MT-TL1 | Дефіцит цитохром-с-оксидази, міоклонічна епілепсія з обірваними червоними волокнами, мітохондріальна міопатія, енцефалопатія, лактоацидоз та інсультоподібні епізоди, синдром діабетичної глухоти, синдром циклічної блювоти, СВДС, сприйнятливість до | Мітохондріальний | 14 | |
MT-TL2 | Мітохондріальний мультисистемний розлад, прогресуюча зовнішня офтальмоплегія, мітохондріальна міопатія, мітохондріальна енцефаломіопатія з лактоацидозом та інсультоподібними епізодами | Мітохондріальний | 5 | |
МТ-ТМ | Синдром Лея, мітохондріальний мультисистемний розлад | Мітохондріальний | 1 | |
MT-TN | Прогресуюча зовнішня офтальмоплегія, мітохондріальний мультисистемний розлад | Мітохондріальний | 3 | |
МТ-ТП | Мітохондріальний | 2 | ||
MT-TQ | Мітохондріальний мультисистемний розлад | Мітохондріальний | 2 | |
MT-TR | Енцефалопатія, мітохондріальна | Мітохондріальний | 2 | |
MT-TS1 | Міоклонічна епілепсія з обірваними червоними волокнами, мітохондріальною міопатією, енцефалопатією, лактоацидозом та інсультоподібними епізодами | Мітохондріальний | 10 | |
MT-TS2 | Мітохондріальний мультисистемний розлад | Мітохондріальний | 2 | |
MT-TT | Мітохондріальний | 5 | ||
МТ-ТВ | Гіпертрофічна кардіоміопатія (ГКМП), синдром Лея, мітохондріальний мультисистемний розлад, мітохондріальна енцефаломіопатія з лактоацидозом та інсультоподібними епізодами | Мітохондріальний | 3 | |
MT-TW | Синдром Лея, міопатія, мітохондріальна | Мітохондріальний | 8 | |
MT-TY | Мітохондріальний мультисистемний розлад | Мітохондріальний | 4 | |
NEUROD1 | Діабет зрілого віку молодого віку | AD/AR | 3 | 18 |
PAX4 | Цукровий діабет | AD | 3 | 10 |
PDX1 | Агенезія підшлункової залози, неонатальний цукровий діабет, діабет молодого віку, тип 4, лактоацидемія внаслідок дефіциту PDX1 | AD/AR | 10 | 28 |
RFX6 | Гіпоплазія підшлункової залози, атрезія кишечника та аплазія або гіпоплазія жовчного міхура з трахео-стравохідною фістулою або без неї, синдромом Мартінеса-Фріаса, синдромом Мітчелла-Райлі | AR | 10 | 31 |
WFS1 | Синдром Вольфрама, вольфрамоподібний синдром, аутосомно-домінантний, глухота, аутосомно-домінантний 6/14/38, катаракта 41 | AD/AR | 69 | 362 |
* Тип успадкування: аутосомно-домінантний (AD), аутосомно-рецесивний (AR), мітохондріальний (mi), Х-зчеплений (XL), Х-зчеплений домінантний (XLD) та Х-зчеплений рецесивний (XLR); ** ClinVar, HGMD - кількість варіантів гена, класифікованих як патогенні або ймовірно патогенні в базі даних ClinVar, HGMD.
В панель дозволяється додати додаткові гени (до 200), пов'язані з симптомами, та видалити будь-які гени (щоб залишилося не менше 2). Вартість панелі може змінюватися, а саме:
- мала панель 2-25 генів ,
- середня панель 26-125 генів ,
- велика панель понад 126 генів .
Якщо аналіз виявив варіанти, що є можливою причиною хвороби, можна перевірити наявність цих варіантів у батьків. Аналіз окремих мутацій по Сенгеру.
Якщо аналіз не виявив варіантів, які є можливою причиною хвороби, можна розширити тестування до повного екзома Розширення панелі до повного екзома. Крім того, можна отримати сирі дані і робити повторну оцінку кожні кілька років. Можливо, згодом науці стануть відомі нові генетичні чинники захворювання.
Натще не потрібно, рясно пити воду.
Проводиться забір венозної крові в пробірку з ЕДТА 4 мл.
Забір матеріалу у нас у центрі або можна передати нам пробірку ЕДТА, взяту у будь-якій лабораторії. Про можливість забору у дітей уточнювати додатково.
У наших пунктах забору крім Києва забор матеріалу коштує .
Необхідно надати висновок лікаря з клінічною картиною (опис симтомів, діагноз), заповнити в електронному вигляді анкету.
Аналіз не проводиться для здорових людей без симптомів, у цьому випадку рекомендуються скринінгові аналізи на носійство.
За результатами секвенування необхідно отримати консультацію лікаря-генетика.